306 Rapport d'activités 2010

Manceau

Description

• cours - matière potentielle : réalisation
• cours - matière potentielle : rédaction
• cours - matière potentielle : du symposium international sur la fixation biologique de l' azote
• cours - matière potentielle : la caractérisation microbiologique
• rapport de stage
• cours - matière potentielle : des doctoriales
• mémoire - matière potentielle : et des articles
• cours - matière potentielle : des différentes campagnes
• mémoire - matière potentielle : master soutenu
• cours - matière potentielle : des commandes
• redaction - matière potentielle : du rapport
• mémoire - matière potentielle : master et de thèse soutenus
• cours - matière potentielle : pour les parcelles situées
• mémoire - matière potentielle : master
• cours - matière potentielle : des journées doctoriales
• exposé

306 Rapport d'activité 2010 Page 1 3ème RAPPORT D'ACTIVITÉS du projet 306 Activités conduites en 2010 A retourner complété à avant le 15 février 2011 Titre du projet : Rôle et caractérisation des symbioses dans deux écosystèmes contrastés : le Sahel et la forêt tropicale humide Pays porteur du projet : Sénégal Coordinateur du projet : Sylla Samba Ndao Institution de rattachement du coordinateur de projet : Université Cheik Anta Diop (UCAD) Correspondant SEP : G.

• diversité des microorganismes symbiotiques
• champignons endomycorhiziens
• impact de plantations monospécifiques d'essences exotiques
• peuplements d'arbre de la zone
• rhizobiums
• spores de champignons
• champignons mycorhiziens
• sénégal
• zones
• zone
• projets
• projet

Sujets

• Réalisation
• Redaction

Informations

• Publié par: istea
• Nombre de lectures: 166
• Langue: Français

Extrait

ème  3 RAPPORT D’ACTIVITÉS ojet 306 du pr Activités conduites en 2010  A retourner complété à [e-mail] le 15 février 2011

Titre du projet : Rôle et caractérisation des symbioses dans deux écosystèmes contrastés : le Sahel et la forêt tropicale humide Pays porteur du projet :Sénégal Coordinateur du projet :Sylla Samba Ndao Institution de rattachement du coordinateur de projet :Université Cheik Anta Diop (UCAD) Correspondant SEP :G. Michaloud Montant total de la contribution SEP :40 K€ Durée du projet :3 ans Auteur(s) du rapport d’activité : Date de fin de rédaction du rapport : Rappel succinct des activités 2008 : Dans le but de connaître l'impact de la flore épigée sur l'abondance et la diversité des microorganismes symbiotiques (rhizobiums et champignons mycorhiziens) du sol ainsi que l'effet de facteurs éco-climatiques sur cette dynamique, nous avons ciblé deux zones de forêt qui présentent des parties bien conservées et des parties dégradées par l'activité humaine. Il s’agit de la forêt de Ziama en Guinée (zone humide) et la réserve sylvicole de Bandia au Sénégal (zone aride). Des missions de prospection, de relevés floristiques et de prélèvements de sol ont été effectuées dans ces sites d’étude. Des échantillonnages ont été effectués sur une quarantaine de parcelles en zone humide de Guinée et en zone sahélienne du Sénégal. L’inventaire de la végétation ainsi que des prélèvements de sols ont été réalisés au niveau des parcelles d’étude en Guinée. Les relevés floristiques ont permis de caractériser la structure et la diversité de la végétation dans les parcelles ciblées. De la même façon des relevés phytosociologiques ont été réalisés à Bandia et la caractérisation de la végétation épigée est en cours pour les parcelles situées à Bandia. La caractérisation microbiologique a permis d’estimer l’abondance des rhizobiums et des champignons mycorhiziens au niveau des parcelles d’étude à Bandia (zone sahélienne). L’étude de la diversité a déjà permis d’établir une centaine de profils RFLP des espèces de Rhizobiacées dans les sols prospectés. L’analyse comparative de ces profils a permis de dégager 8 profils types. Les analyses de sol sont en cours, pour déterminer les caractéristiques physiques et chimiques du sol. Rappel succinct des activités 2009 : Des missions de prospection, de relevés floristiques et de prélèvements de sol ont été effectuées dans les sites d’étude à Bandia au Sénégal. Les échantillonnages ont été effectués sous les peuplements d’arbres dans la réserve forestière protégée et sous couvert végétal dans la zone contiguë non protégée. L’inventaire de la végétation et les relevés floristiques ont permis de

306 Rapport d’activité 2010

Page 1

dresser la liste des essences végétales exotiques et locales dans les deux zones protégée et non protégée ainsi que la microflore sous-jacente. Au cours de la caractérisation microbiologique, l’abondance des rhizobiums et des champignons endomycorhiziens sous les différents peuplements (parcelles) a été estimée. Pour les espèces de Rhizobiacées dans les sols prospectés, la diversité a été explorée par PCR-RFLP de l’IGS 16S-23S de l’ADNr. De nouveaux profils RFLP-IGS ont été obtenus et l’analyse comparative des profils retrouvés a permis de distinguer d’autres groupes par similarité de profils. Résumé des activités 2010 : Des missions de prélèvement de sols a été effectuées dans les mêmes endroits où ont été effectués les premiers prélèvements de sols. L’inventaire floristique de la végétation a été effectué hors de la station et dans la station sous les peuplements d’arbres. La taille des populations de rhizobiums et de champignons mycorhiziens arbusculaires (MA) a été déterminée par la méthode des most probable number (MPN). Les rhizobiums ont été piégés en utilisant les plantes piègesM. atropurpureum etA. seyal qui sont non spécifiques en symbiose avec les rhizobiums. Les isolements de rhizobiums ont été effectués à partir des nodosités obtenus. Les isolats ont été caractérisés par PCR/RFLP de l’espace intergénique (IGS) 16S–23S de l’ADN rhibosomique. Les différents groupes IGS/RFLP ont été testés pour leur capacité à s’associer et à améliorer la croissance de 5 espèces légumineuses locales et 3 espèces légumineuses exotiques. Pour le piégeage des champignons MA, le maïs (Zea mays) a été utilisé en serre. Les spores ont été extraites la méthode des tamisages humides après 4 mois de culture en pots. Les différents morphotypes ont été regroupés et identifiés par des observations microscopiques. L’ADN des fragments de racines mycorhizées a été extrait et une nested PCR (PCR gigogne) effectuée sur les extraits. Des amplifications spécifiques sont en cours pour déterminer les groupes de champignons MA présents dans les racines. 1. Objectifs : Environ une demi-page -Rappelez les objectifs du projet, tels qu’ils ont été présentés dans le formulaire définitif soumis à Sud Expert Plantes Les rhizobiums et les champignons mycorhiziens sont des composantes de la microflore tellurique qui jouent un grand rôle dans l'amélioration de la fertilité des sols et l'adaptation des plantes aux sols pauvres. En zone tropicale, la pression anthropique a entraîné un recul du couvert végétal ligneux. L'impact de cette dégradation au niveau de la diversité et de l'abondance des rhizobiums et des champignons (facteur d'enrichissement) du sol est très peu connu. Ce projet a pour objectif de connaître l'impact de la flore épigée sur l'abondance et la diversité microbienne du sol et de déterminer l'effet de facteurs éco-climatiques sur cette dynamique. Les zones ciblées sont la forêt de Ziama en Guinée (zone humide) et la réserve sylvicole de Bandia au Sénégal (zone aride). Il s'agit de deux zones de forêt naturelle qui présentent des espaces bien conservés et des espaces dégradés par l'activité humaine. Plusieurs activités seront menées pour atteindre cet objectif. Il s'agira de: Caractériser la diversité de la flore épigée dans des parcelles non dégradées et dans des parcelles dégradées au niveau de chaque zone ; Caractériser la diversité des rhizobiums et des champignons mycorhiziens dans ces différentes parcelles ; Corréler la diversité de la flore épigée et celle de la microflore symbiotique ; Comparer et analyser les résultats obtenus entre la zone humide et la zone aride. L’analyse comparée des résultats entre parcelles dégradées et parcelles non-dégradées ainsi que ceux entre les deux zones éco-climatiques contrastées permettra de connaître les tendances évolutives de la communauté microbiennes du sol. 2. Partenariat : Rappelez les partenaires du projet dans le tableau suivant – Rajoutez des lignes si nécessaire

306 Rapport d’activité 2010

Page 2

Nom Intitulé Tutelle Compétence Localisation BA UAG Amadou Microbiologie Guadeloupe UCAD F Di DIOU Senegalegane Microbiologie IRD DUPONNOIS Robin Microbiologie Senegal UCAD KANE Aboubacry Microbiologie Senegal UCAD MBAYE Mame Samba Botaniste Senegal UCAD NDOYE Ibrahima Microbiologie Senegal IRD NEYRA FranceMarc Microbiologie IRAD DIABATEMoussa Botaniste Seredou/Guinée Ss Contrat Microbiologie THIAO Mansour Senegal Etudiant Microbiologie SENE Godar Senegal 3. Méthodologie et moyens mis en œuvre : maximum une demi-page La méthodologie a consisté à faire des campagnes de relevés floristiques et de collecte d’échantillons de sols sur lesquels les travaux de laboratoire sont effectués. L’estimation de l’abondance et de la diversité des microorganismes a été faite sur les échantillons de sols. Les relevés floristiques ont servi à étudier l’abondance et la diversité de la flore épigée. Dans l’ensemble la caractérisation des microorganismes a été réalisée avec des outils de biologie moléculaire qui ont permis d’affiner les caractères morphologiques et morpho-anatomiques. Dans le cas des espèces de la flore épigée, des outils taxonomiques et écologiques ont été mis en œuvre pour l’identification et l’estimation de l’abondance. Dans outils statistiques ont été utilisés dans les analyses comparatives données recueillies. A propos des moyens, toute l’équipe a été impliquée dans la réalisation des travaux depuis les professeurs jusqu’aux étudiants dont leur participation a été très effective. Les moyens financiers ont été également disponibles au cours des différentes campagnes mais aussi au cours des commandes de matériel et de produits pour les analyses. 4. Travaux réalisés sur l’année 2010 : Maximum une page pour l’ensemble des items 4 Les échantillons de sols ont été prélevés en fin de saison pluvieuse sous chaque peuplement d’arbre de la zone protégée et les sols témoins à la lisière sous les arbres et hors couvert arbre. Ces sols ont été utilisés dans l’étude de l’abondance et de la diversité des rhizobiums et des mycorhizes. La méthode de MPN décrite par Gemell et al. (1995) a été utilisée pour l’estimation de l’abondance des rhizobiums dans les solsMacroptilium atropurpureum etAcacia seyal comme plantes piége. La méthode de MPN décrite par Plenchette et al. (1983) a été utilisée pour l’estimation de l’abondance des propagules mycorhiziens dans les solsZea mayscomme plante piége. Les racines mycorhizées a été révélées par observation histologique après coloration au bleu de Trypan. Des séries de piégeages de rhizobiums ont été effectuées en chambre de culture en utilisant les plantes hôtesM. atropurpureum etA. seyalpour leur capacité à s’associer aussi bien connues avec les rhizobiums à croissance rapide qu’avec les rhizobiums à croissance lente. Les nodosités ont été lavées à l’eau distillée stérile et désinfectées.

306 Rapport d’activité 2010

Page 3

L’isolement a été effectué à partir des nodosités récoltées après piégeage. Un broyat de chaque nodosité a été étalé sur boîtes de Pétri contenant du YMA (Vincent, 1970). Chaque souche isolée puis purifiée a été mise en culture dans du YM puis testées pour son aptitude à engendrer une nodulation en chambre de culture. Le test de nodulation décrit par Gibson (1963) a été utilisé avec les plantes d’isolementM. atropurpureumetA. seyal. Des jeunes plants ont été inoculés avec 1 ml de la culture bactérienne en phase exponentielle de croissance en présence de plants témoins non inoculés. La présence de nodosités a été vérifiée à la fin de la culture. La méthode de piégeage décrite par Morton (1992) a été utilisée avecZea maisdans des cultivé pots de capacité 1 kg. Les plants ont été inoculés avec du sol des plantations et ont été régulièrement selon le stade de culture pour une durée de 5 mois. La méthode d’extraction de spores décrite par Gerdemann et Nicolson (1963) a été utilisée sur les sols prélevés des plantations et sur le substrat de culture du piégeage. Les spores récoltées ont été triées sous la loupe binoculaire suivant les caractéristiques : couleur, taille, forme et attachement de l’hyphe (Walker, 1983). L’abondance des spores a été déterminée par comptage direct sous la loupe binoculaire et l’abondance relative de chaque espèce ou genre a été calculée comme étant le nombre de spore de cette espèce ou de ce genre que divise le nombre total de spores. L’ADN total des fragments de racines de maïs mycorhizées a été extrait à l’aide du kit Dneasy plant mini kit (QIAGEN) suivant les instructions du fabricant. L’amplification a été effectuée suivant le protocole décrit par Redecker (2000). Deux étapes d’amplification ont été réalisées (nested PCR). La première phase consiste à amplifier la région ITS entre la région 18S et 28S en utilisant les amorces universelles NS5 et ITS4. Cette amplification a été réalisée en suivant le même programme décrit pour l’amplification des souches de rhizobiums avec une température d’hybridation des amorces de 51°C. Les travaux sur les amplifications spécifiques et le séquençage des différents groupes sont en cours. La caractérisation génétique des rhizobiums a été réalisée à partir de la culture liquide des souches de rhizobiums authentifiées. Des billes lyophilisée de « Taq Ready-To-Go » (Amersham Pharmacia Biotech), les amorces FGPS1490-72 (Forward 5’-TGCGGCTGGATCCCCTCCTT-3’, Navarroetalet., 1992) FGPL132-38 (Reverse 5’-CCGGGTTTCCCCATTCGG-3’,Ponsonnet et Nesme, 1994) ont été utilisées ® pour l’amplification de l’IGS à l’aide d’un thermocycleur Gene Amp PCR System 2400 (Perkin Elmer). Le succès de l’amplification a été contrôlé par électrophorèse horizontal sur gel d’agarose. Les échantillons ayant montrés une bonne amplification ont été digérés. Les produits de PCR ont été digérés avec les enzymes de restrictionMspI etHaeIII (Amersham Pharmacia Biotec). La migration et la révélation des fragments de restriction ont été réalisées par électrophorèse sur gel. Les profils obtenus ont été analysés et comparés entre eux. 4.1 - Contexte et difficultés rencontrées : La suspension précoces (mois de novembre) des dépenses budgétaires ainsi que le démarrage tardif (mois de février) est un écueil dans les activités du projet. 4.2 - Missions Godar Séne : Congrés AABNF, Tunis novembre 2008 Sylla Samba Ndao, stage, MNHN, Paris, novembre 2009 Mbaye Mame Samba stage, MNHN, Paris, novembre 2009 4.3 – Résultats :

Au niveau scientifique

Caractérisation de la diversité et de l’abondance de la flore épigée Les résultats montrent que a flore vasculaire est composée de 106 espèces, 79 genres et 30 familles. Les Dicotylédones (73,6%) dominent les Monocotylédones (26,4%). Dans cette flore, 6 familles regroupent près de 60% des espèces (Fabaceae, Poaceae, Cyperaceae, Amaranthaceae,

306 Rapport d’activité 2010

Page 4

Convolvulaceae et Malvaceae). Près de 71% des espèces sont des therophytes suivies des phanérophytes (22,64%). L’essensiel de cette flore est constitué d’espèces d’origine Africaine (36,79%), pantropicale (22,64%) et asiatique (15,09%). Les espèces les plus fréquentes sontMitracarpus villosus, Cassia obtusifolia, Acalypha crenata, Achyranthes aspera, Cucumis melo, Rhynchosia minima, Stylochyton hypogea, Commelina benghalensis,alors que les plus dominantes sont Cyperus rotundus, Fimbristylis exilis, Cyperus esculentus, Cassia obtusifolia, Brachiaria racemosa, Mitracarpus.Parmi ces espèces, les plus importantes sontCassia obtusifolia etMitracarpusvillosussont très fréquentes avec un qui recouvrement non négligeable. La zone non dégradée montre une plus grande diversifiée spécifique. En effet, il y a eu en milieu dégradé 49 genres et 56 espèces contre respectivement 69 genres et 89 espèces en milieu non dégradé. Parmi les 30 familles représentées dans la zone, 18 sont indifférentes de la dégradation du milieu alors que 3 familles sont absentes en milieu non dégradé et 9 en milieu dégradé. La flore est plus diversifiée dans les parcelles non reboisées que dans les parcelles monospécifiques. En outre la richesse spécifique sous jacente dépend des essences plantées. Caractérisation physico-chimique du sol et caractérisation de la diversité et de l’abondance de la microflore sous-jacente Il ressort de cette étude que la taille des populations de rhizobiums de même que la teneur des sols en N, P et C ont été significativement plus élevées dans les sols collectés sous les peuplements d’arbre de la zone protégée par rapport aux différents échantillons de sols collectés dans la zone dégradée. Ces résultats montrent un effet positif des peuplements d’arbres sur les teneurs des sols N, P et C. Il est noté sous les plantations d’arbres dans cette zone protégée, une baisse significative du nombre total de propagules mycorhiziens et l’abondance des sols en spores. Une variation saisonnière a été aussi notée sur la taille des populations de microorganismes symbiotiques du sol, les rhizobiums et les spores de champignons MA sont plus abondants en saison humide qu’en saison sèche et le nombre total des propagules de champignons MA est plus élevé en saison sèche. Au total 1642 isolats purs de rhizobiums ont été collectés et caractérisé par PCR/RFLP. La comparaison des différents profils obtenus a permis de les regrouper en 37 groupes IGS/RFLP suivant leur ressemblance. Parmi ces différents groupes IGS, 81% des souches types se retrouvent sous les peuplements d’arbres de la zone protégée, alors que 19% ont été rencontrés hors de la zone protégée. Des profils IGS identiques communs aux deux sites ont également été obtenus et représentent 17%. Les données obtenues sur le calcul des différents indices de diversité ont montré une plus grande diversité des populations de rhizobiums dans les sols des peuplements d’arbres de la zone protégée par rapport aux sols dans la zone non protégée. La diversité génétique des rhizobiums, estimée à travers les indices de Shannon (H’), Simpson (1-D) et Margalef (R), est plus élevée dans la zone non dégradée (protégée). Une plus grande abondance et diversité des rhizobiums à croissance rapide a été notée sous les peuplements de légumineuses arbres symbiotiques. Ces rhizobiums à croissance rapide, testés en conditions contrôlées, ont montré une préférence symbiotique avec les essences légumineuses.Ces peuplements de légumineuses créeraient, à travers ce caractère symbiotique, un environnement favorable à la croissance et à la multiplication des rhizobiums à croissance rapide. L’identification morpho-anatomique des spores de champignons MA a permis de déceler 9 morphotypes. Parmi ces morphotype, 4 taxa ont été rencontrés sous les peuplements d’arbres de la zone protégée, 8 taxa dans la zone protégée hors couvert des peuplements et 6 taxa dans la zone dégradée. Ce résultat, qui corrobore aussi les données obtenues sur les différents indices calculés (richesse en morphotypes, diversité et équité de leur répartition).

306 Rapport d’activité 2010

Page 5

L’analyse des statuts mycorhiziens des différents arbres de la réserve et des systèmes racinaires des espèces herbacées les plus abondamment rencontrées ont montré une plus grande infection des racines des herbacées par rapport à la plupart des arbres étudiés. Ce résultat démontre l’importance de la contribution des herbacées annuelles dans le maintient et l’augmentation du potentiel infectieux mycorhizogène des sols. Ces herbacées présentant une plus grande richesse et abondance hors des plantations, leur contribution dans le potentiel infectieux des sols expliquerait les différences notées sur la taille des propagules de champignons MA (Figure 6). Les données obtenues sur l’indice de Sorenson ont montré une grande variabilité de la diversité des populations de rhizobiums (Cs<30%), alors que la composition des communautés de champignons MA n’a pas été drastiquement affectée (Cs>71%) suivant le couvert végétal des zones protégée et zone non protégée.

Au niveau institutionnel Le projet a contribué à la formation de deux étudiants en Master, deux en thèse de l’UCAD et un en doctorat d’état. Le projet a également, partiellement supporté la thèse de doctorat d’état de Mr. Diégane Diouf, soutenu en décembre 2010. Dans une certaine mesure, le projet a contribué au renforcement de l’équipe. Des membres de l’équipe d’exécution du projet sont enseignants à l’UCAD et participe à la formation des étudiants dans les différents cycles universitaires. Un partenariat interinstitutionnel a été établi avec l’IRD via le laboratoire commun de microbiologie qui a accueilli des étudiants du projet, le Muséum d’Histoire Naturelle de Paris qui a accueilli Pr SYLLA et Dr MBAYE en voyage d’étude, l’ISRA dont des agents sont membres du projet et qui a mis à notre disposition le site de Bandia (zone protégée) où les travaux ont été réalisés et l’IRAG de Guinée en la personne de Moussa Diabaté. Dans le cadre de la valorisation Les résultats obtenus dans ce projet ont été présentés (présentations orales et posters) au cours des Doctoriales de l’Université Cheikh Anta Diop de Dakar. Une présentation orale a été faite à Cape Town en Afrique du Sud au cours du symposium international sur la fixation biologique de l’azote en Afrique du 21 au 26 Novembre 2010. Une exposition de poster a été faite au symposium international organisé par la FAO sur l’horticulture urbaine et périurbaine au siècle des villes tenu au Sénégal du 6 au 9 décembre ème 2010. Des présentations orales et par posters ont également faites au 14 congrès international (AABNF) sur la fixation biologique de l’azote tenu à Bamako au Mali du 12 au 16 décembre 2010. Au cours de ce congrès, des contacts ont été établis avec la coordonatrice du prochain AABNF ( Prof. Nancy Karanja Director, MIRCEN project, (LARMAT) Faculty of Agriculture & Veterinary Sciences University of Nairobi) aura lieu au Kenya. Un mémoire de Master a été soutenu et un autre est en cours de qui réalisation. Une thèse de l’UCAD est également réalisée par Godar SENE dans ce projet ainsi qu’une partie de thèse de doctorat d’état par Mansour Thiao. Un article est en cours de rédaction avec Godar SENE comme premier auteur.

Liste de communications orales, des posters, des mémoires et des articles : Communications orales : -A. Manga, R. Samba-Mbaye, M. Gueye, F. Gueye, M. S.Sene G., M. Thiao, A. Kane, Mbaye & S. N. Sylla. Impact of monospecific plantations of tropical, subtropical and exotic tree species on the mycorrhizal soil infectivity and arbuscular mycorrhizal fungal spores communities.Congrès international sur les mycorhizes, Dakar–Sénégal, Février 2011. -Sene G., M. Thiao, R. Samba-Mbaye, A. Manga, M. Gueye, A. Kane, D. Diouf, M. S. Mbaye, A. Thiam & S. N. Sylla. Impact of monospecific plantations of tropical, subtropical and exotic trees on the abundance and diversity of populations of rhizobia.Congrès sur la fixation biologique de l’azote, Pretoria–Afrique de Sud, 21–28 Novembre 2010. -Sene G., M. Thiao, R. Samba-Mbaye, A. Manga, M. Gueye, A. Kane, D. Diouf, M. S. Mbaye, A. Thiam & S. N. Sylla. Impact de plantations monospécifiques d’essences exotiques et

306 Rapport d’activité 2010

Page 6

ème locales du sahel sur l’abondance et la diversité des rhizobiums du sol.de l’AABNF,14 congrès Bamako–Mali, 12–17 Décembre 2010http://www.aabnfmali2010.org/spip.php?article3. -R. Samba-Mbaye, A. Manga, Sene G., M. Thiao, M. Gueye, A. Kane, D. Diouf, M. S. Mbaye, A. Thiam & S. N. Sylla (2009). Impact de plantations monospécifiques d’essences exotiques et locales sur l’abondance et la diversité des microorganismes symbiotiques (rhizobiums et champignons endomycorhiziens) dans une zone préservée.Doctoriales de l’école doctorale SEV–UCAD, Décembre 2009. -D. Diouf, S. N. Sylla. (2008). Effect ofG. Sene, F. Ndoye, M. Thiao, R. Samba, A. Kane, both inoculation with two bradyrhizobium strains andGlomus intraradicesthree peanut on ème cultivar (Arachis hypogaea L.) grown in Senegalese soil.de l’AABNF,13 congrès Hammamet–Tunisie, 15–18 Décembre 2008http://www.aabnf2008.fr.gd/Program.htm Posters: -R. Samba-Mbaye, A. Manga, M. Gueye, A. Kane, D. Diouf, M. S.Sene G., M. Thiao, Mbaye, A. Thiam & S. N. Sylla. (2010). Effet du couvert ligneux sur les communautés microbiennes symbiotiques (rhizobiums et champignons MA) du sol : cas de la réserve forestière ème de Bandia au Sénégal.14 congrès de l’AABNF, Bamako–Mali, 12–17 Décembre 2010. -Ndoye, F., Sene, G., Gueye, O., Samba Mbaye, R.T., Sylla, S.N. And Kane, A., (2008). Arbuscular mycorrizal fungi and/or rhizobia improve millet mycorrizal infection and growth after ème peanut millet rotation.de l’AABNF, Hammamet–Tunisie Décembre 200813 congrès . -Ngom A., Kane A, Sylla SN, Noba K et Mbaye MS. (2010).. Etude de deux espèces protégées intégralement (Celtis integrifolia Lam.Ulmaceae) et partiellement (Grewia bicolor Juss.Tiliaceae) dans la forêt de Bandia : structure de la population, régénération naturelle, savoirs locaux et perspectives d’une gestion durable. Exposé au département de Biologie Végétale, UCAD, Dakar -Diane O., Sanogo D., Kane A., Ndiaye S., Noba K. (2010).CaractérisationMbaye M.S., de la variabilité morphologique du baobab (Adansonia digitataL.) au Sénégal » présenté au cours des journées doctoriales du 24 au 26 novembre 2010 à l’UCAD. - Articles : -Mbaye M.S, Diedhiou B., Noba K. (2010)Diane O., Sanogo D., Kane A., Ndiaye S., Caractères morphologiques de semences et production foliaire de jeunes plants de baobab (Adansonia digitataL.) au Sénégal » accepté dans le revu universitaire de l’UCAD -Sene G, Thiao M, Samba Mbaye R, Ndoye F, Kane A, Diouf D and Sylla S N (2010). Response of three peanut cultivars toward inoculation with twoBradyrhizobiumstrains and an arbuscular mycorrhizal fungus in Senegal. African Journal of Microbiology Research Vol. 4(21) pp. 2520-2527. URL: -Diouf D, Fall D, Chaintreuil C, Ba AT, Dreyfus B, Neyra M, Ndoye I, Moulin L (2010). Phylogenetic analyses of symbiotic genes and characterization of functional traits of Mesorhizobium spp. strains associated to a promiscuous species Acacia seyal Del. Journal of Applied Microbiology, 108: 818-830. -Fall D, Diouf D, Ourarhi M, Faye A, Abdelmoumen H, Neyra M, Sylla SN and Missbah El Idrissi M (2008). Phenotypic and genotypic characteristics of Acacia senegal (L.) Willd. root- nodulating bacteria isolated from soils in the dryland part of Senegal. Letters in Applied Microbiology 47: 85-97. -Fall D, Diouf D, Diouf O, Neyra M, Diallo N (2009). Physiological and biochemical responses of Acacia seyal (Del.) seedlings under salt stress conditions. Journal of Plant Nutrition, 32: 1122-1136. URL : http://dx.doi.org/10.1080/01904160902943155. -Sanon A., F. Ndoye, E. Baudoin, Y.Prin, A. Galiana and R. Duponnois (2010) Management of the Mycorrhizal Soil Infectivity to Improve Reforestation Program Achievements in Sahelian Ecosystems Applied Microbiology & Microbial biotechnology

306 Rapport d’activité 2010

Page 7

-Abdoulaye Soumaré. 2010. Analyse de la diversité des champignons dans des champs d’Eucalyptus par PCR-TTGE. Rapport de stage Université de Nancy, 12pp -A. Manga, R. Samba-Mbaye, M. Gueye, , A. Ba, F. GueyeSene G., M. Thiao, A. Kane, & S.N. Sylla (2011). Abundance and diversity of legume nodulating rhizobia in soils from monospecific plantations of tropical, subtropical and exotic trees in the reserve forestry of Bandia, Senegal (submitted African Journal of Microbiology) -Sene G., M. Thiao, A. Kane, A. Manga, R. Samba-Mbaye, M. Gueye, , A. Ba, R. Duponnois & S.N. Sylla (2011) Mycorrhizal inoculums potential of soils from monospecific plantations of tropical, subtropical and exotic trees in the reserve forestry of Bandia, Senegal (in prep.) - Articles en cours de rédaction : -SENE et al. Abundance and diversity of legume nodulating rhizobia in soils from monospecific plantations of tropical, subtropical and exotic trees in the reserve forestry of Bandia, Senegal -SENE et al. Mycorrhizal inoculums potential of soils from monospecific plantations of tropical, subtropical and exotic trees in the reserve forestry of Bandia, Senegal

Mémoires de Master et de thèse soutenus ou en cours de réalisation : -Ablaye NGOM. 2010. Mémoire de Master soutenu publiquement au Département de Biologie Végétale le 23/12/2010. Etude de deux espèces protégées intégralement (Celtis integrifolia Lam. Ulmaceae) et partiellement (Grewia bicolor Juss. Tiliaceae) dans la forêt de Bandia : structure de la population, régénération naturelle, savoirs locaux et perspectives d’une gestion durable. UCAD, Dakar -: Thèse en cours Omar DIANE : Impact des plantations monospécifiques exotiques (Eucalyptus camaldulensis, Jatropha curcas L.,) et locales (Acacia senegal) sur la diversité de la flore épigée au Sénégal -: Contribution des bactériesMansour THIAO Thèse d’état de l’UCAD en cours symbiotiques et des champignons mycorhiziens à l’établissement d’arbres et à la reforestation -: Impact des plantations monospécifiques d’essencesGodar SENE, Doctorat UCAD exotiques et d’essences locales sur la diversité et l’abondance des microorganismes symbiotiques dans un sol sahélien

5. Analyse critique de la gestion de SEP : Maximum une demi-page - Quels sont les principaux regrets que les équipes nourrissent vis-à-vis des instances en charge du fonctionnement de SEP ? - MAE, SCAC, Correspondants, Coordinateurs, Régies IRD, Secrétariat Exécutif 6. Remarques générales et conclusions : Maximum une demi-page

306 Rapport d’activité 2010

Page 8