Etude de la structure en taille de la communauté planctonique du golfe de Gascogne à l'aide d'un compteur

François Cabane / Ifremer, Benjamin Planque

Description

èmeProposition de stage de 2 année de Master de Science de l'Univers, environnement,écologie, spécialité océanographie et environnements marins.TitreEtude de la structure en taille de la communauté planctonique du golfe de Gascogne à l'aide d'uncompteur laser de particules in situ (LOPC).Maître de Stage:Benjamin PlanqueIFREMER, Laboratoire d'Ecologie Halieutique, BP 21105, 44311 Nantes Cedex 03Tel: [phone], / Fax: [phone]e-mail: [e-mail] du sujetDans le golfe de Gascogne, la distribution spatiale des populations de poissons est influencée par lesconditions hydrologiques et trophiques locales. Si les conditions hydrologiques peuvent être décritespar un nombre de paramètres restreints (ex: température, salinité), il est plus difficile de résumer l'étattrophique du système. Une voie d'approche est l'étude de la structure en taille de la communautéplanctonique (Zhou and Huntley, 1997, Sourisseau, 2003). Les mesures de spectre de taillepermettent de mesurer de manière quantitative des paramètres clés de la dynamique de lacommunauté planctonique liés à sa structure et son niveau de production. Les premières mesuresoptiques de spectre de taille ont été principalement réalisées grâce au compteur optique de particule(OPC) en laboratoire. Un appareil plus récent, le Laser-OPC, permet de réaliser des mesures despectre in situ, à haute fréquence, avec une meilleure résolution et une gamme plus large de ...

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Extrait

Stage 2

ème

année Master – Ifremer/Ecohal

1/2

Proposition de stage de 2

ème

année de Master de Science de l'Univers, environnement,

écologie, spécialité océanographie et environnements marins.

Titre

Etude de la structure en taille de la communauté planctonique du golfe de Gascogne à l'aide d'un

compteur laser de particules in situ (LOPC).

Maître de Stage:

Benjamin Planque

IFREMER, Laboratoire d'Ecologie Halieutique, BP 21105, 44311 Nantes Cedex 03

Tel: [phone], / Fax: [phone]

e-mail: [e-mail]

Description du sujet

Dans le golfe de Gascogne, la distribution spatiale des populations de poissons est influencée par les

conditions hydrologiques et trophiques locales. Si les conditions hydrologiques peuvent être décrites

par un nombre de paramètres restreints (ex: température, salinité), il est plus difficile de résumer l'état

trophique du système. Une voie d'approche est l'étude de la structure en taille de la communauté

planctonique (Zhou and Huntley, 1997, Sourisseau, 2003). Les mesures de spectre de taille

permettent de mesurer de manière quantitative des paramètres clés de la dynamique de la

communauté planctonique liés à sa structure et son niveau de production. Les premières mesures

optiques de spectre de taille ont été principalement réalisées grâce au compteur optique de particule

(OPC) en laboratoire. Un appareil plus récent, le Laser-OPC, permet de réaliser des mesures de

spectre in situ, à haute fréquence, avec une meilleure résolution et une gamme plus large de taille de

particules observées. Ce système permet de mesurer des profiles verticaux particulaires (selon une

méthodologie similaire à celle des mesures hydrologiques in situ).

L'objectif de l'étude est de mettre à profit les données acquises grâce au LOPC afin de construire les

indicateurs de la dynamique zooplanctonique pertinents pour l'halieutique.

Le laboratoire Ecohal de Nantes dispose depuis 2003 d'un LOPC. Des mesures de spectre de taille

ont été réalisées durant deux campagnes : JUVAGA-2003 et PELGAS-2004. Durant la campagne

PELGAS-2004, des analyses complémentaires ont été effectuées afin d'évaluer la production meso-

zooplanctonique par voie enzymatique.

L'étude aura pour but :

-

de réaliser une cartographie tri-dimensionelle des spectres de taille dans le golfe de Gascogne, à

partir des données des campagne JUVAGA-2003 et PELGAS-2004 ainsi que de la campagne

PELGAS-2005 (Mai 2005),

-

d'évaluer la correspondance entre les mesures enzymatiques de production biologique et les

spectres de taille issus du LOPC.

Travail envisagé

Le travail de DEA se décomposera en plusieurs actions :

1.

Mise en place d'un protocole de traitement des données LOPC,

2.

Comparaison des données LOPC et des données enzymatiques de la campagne PELGAS-2004,

3.

Cartographie tri-dimensionnelle des données LOPC pour les campagnes JUVAGA-2003,

PELGAS-2004 et PELGAS-2005,

4.

Participation à la campagne PELGAS-2005 pour la mesure des profils particulaires et

l'échantillonnage planctonique.

Profil du candidat

Le candidat devra avoir une bonne maîtrise des statistiques classiques ainsi que des méthodes

d'analyse de données. Il devra également montrer une grande aptitude à intégrer et utiliser des

méthodes numériques nouvelles. La connaissance d'un langage de programmation est essentielle

(Matlab ou S-Plus de préférence).

Stage 2

ème

année Master – Ifremer/Ecohal

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Références

Sourisseau, M. 2003. Etude de la structure de taille de la communauté des copépodes par l'analyse

de spectres mesurés avec un compteur optique et par la modélisation de la dynamique des

populations. - PhD, Pierre et Marie Curie, Paris.

Zhou, M. and Huntley, M. E. 1997. Population dynamics theory of plankton based on biomass spectra.

- Mar. Ecol. Prog. Ser. 159: 61-73.

Illustrations

A gauche, calibration du LOPC à l'aide de billes de verre dans le laboratoire physique du N/O Thalassa. A droite,

mise à l'eau de la sonde CTD et du LOPC pour un profil vertical. Campagne JUVAGA03.

Un exemple de mesures réalisées durant la campagne JUVAGA03. A gauche, les profils verticaux de particules

et température indiquant un maximum dans la thermocline et un second maximum en profondeur. Au milieu, un

spectre de taille sur la gamme 75-1500 microns (diamètre sphérique équivalent). A droite, les "formes" des

particules de grande taille (1.5 à 35 mm) enregistrées par le LOPC.