Université de la Méditerranée Aix-Marseille II Faculté des ...

Christophe Robaglia

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• Nombre de lectures: 52
• Langue: Français

Extrait

Université de la Méditerranée Aix-Marseille II

Faculté des Sciences de Luminy

Master M1 2008

Unité d’Enseignement Virologie fondamentale

TD2 Structure, fonction et inhibition des polymérases des virus à ARN (Barbara Selisko)

Discussion d’un projet de recherche en cours

à l’ AFMB (CNRS, Université de la

Méditerranée Aix-Marseille II, Faculté des Sciences Luminy) dans le groupe « Viral

replicases : structure, function and drug design (DR Bruno Canard)

4 articles sont donnés mais ce n’est pas nécessaire de lire les quatre entièrement ! Pour

chaque article il faudrait lire l’introduction et se focaliser sur les figures (résultats et

matériel/méthodes correspondants) qui vont être discutées !

Projet : Caractérisation du domaine polymérase du virus de la dengue et recherche

d’inhibiteurs.

Introduction of flaviviruses with a focus on dengue and of the RNA-dependent RNA

polymerase (RdRp) as a target of antivirals (B. Selisko)

Expression et caractérisation fonctionnelle des polymérases des flavivirus notamment de virus

de la dengue et de West Nile

Article 1

Selisko B , Dutartre H, Guillemot JC, Debarnot C, Benarroch D, Khromykh AA, Despres P,

Egloff M-P and Canard B. (2006) Comparative mechanistic studies of

de novo

RNA synthesis

by flavivirus RNA-dependent RNA polymerases. Virology. 35:145-58.

Présentation des résultats suivants et de l’approche expérimentale mise en oeuvre (explication

des principes et détails) par un étudiant (projection des figures assurée par B. Selisko en

powerpoint):

Protein expression in

E.coli

and purification (Fig 2 and Table 1)

Characterization of enzymatic activity (test on polyC) (Fig 4)

Steady state parameters on polyC (Fig 6 and Table 2)

Structure 3D de la polymérase du virus de la dengue

Article 2

Yap TL, Xu T, Chen YL, Malet H, Egloff MP, Canard B, Vasudevan SG and Lescar J. (2007)

Crystal structure of the dengue virus RNA-dependent RNA polymerase catalytic domain at

1.85-angstrom resolution. J Virol. 81:4753-65.

Présentation des donnés (sans détails expérimentaux) par un étudiant (projection des figures

assurée par B. Selisko en powerpoint):

Structure de la polymérase du virus de la dengue (Fig 2 A to D)

Model du complexe ternaire (Fig 5)

Activity assay for inhibitor screening (Fig 1 B and C)

Screening of chemical libraries at the AFMB (Explanation of principle (B. Selisko, 5 min))