ANÁLISIS ELECTROFORÉTICO DE CUATRO LOCI DE PROTEÍNAS SÉRICAS EN DIVERSAS POBLACIONES DEL PONI VASCO-POTTOKA(ELECTROFORETIC ANALYSIS OF FOUR SERUM PROTEIN LOCI IN SEVERAL POPULATIONS OF PONI VASCO-POTTOKA)

Arruga M.V.

Description

Resumen
Se han analizado cuatro loci de proteínas séricas (TF, GC, A1B y AL) en un total de 72 ponis vascos, correspondientes a cuatro poblaciones. Se han observado en TF un total de 7 alelos, si bien TF*F1 y TF*F3 son muy raros y TF*E estuvo ausente de una de las poblaciones consideradas. Los loci GC y AL fueron dialélicos en todos los casos. El locus A1B fue dialélico salvo en dos poblaciones
en una de ellas el alelo A1B*K estaba fijado y en otra aparecía el alelo A1B*F con muy baja frecuencia. En todos los casos, se ha apreciado equilibrio de Hardy-Weinberg. Se calcularon para cada población la heterocigosidad observada y esperada, el porcentaje de polimorfismo al 95 p.100 y al 99 p.100 y el número medio de alelos por locus. El cálculo de los índices de fijación medios mostró un valor no significativo para FIS (0,0379±0,0920, p>0,05), mientras que fueron altamente significativos los valores de FST (0,1164±0,0693, p<0,01) y FIT (0,1499,±0,1352 p<0,01). De este modo, aunque puede considerarse que existe divergencia genética significativa entre las poblaciones analizadas, no se ha detectado consanguinidad significativa dentro de las mismas. Por otro lado, se ha calculado el número de alelos efectivos y el PIC para cada locus en cada población
en todos los casos, los valores más altos correspondieron a TF. La probabilidad de exclusión de paternidades erróneas, considerando los cuatro loci conjuntamente, varió entre poblaciones, desde un valor mínimo de 0,5798 hasta un valor máximo de 0,7478.
Abstract
Four serum protein loci (TF, GC, A1B and AL) have been analysed in 72 poni vasco Pottokka individuals, belonging to four populations. Seven TF alleles have been observed, but TF*F1 and TF*F3 were rare and TF*E was absent from one of the considered populations. GC and AL were diallelic loci in every case. A1B was a diallelic locus, except for two populations
in one of them A1B*K allele was fixed and in the other one A1B*F allele showed a very low frequence. Hardy-Weinberg equilibrium was found in every case. Observed and expected heterozygosity, percent of polymorphism (95 and 99 p.100) and mean number of alleles per locus were calculated for each population. The calculation of fixation indexes showed a not significant value for FIS (0.0379±0.0920, p>0.05), but FST (0.1164±0.0693, p<0.01) and FIT (0.1499±0.1352 p<0.01) had highly significant values. Although we can consider that significant genetic divergence exists among the analysed populations, significant consanguinity has not been detected in any of them. On the other hand, number of effective alleles and PIC have been calculated for each locus and population
in every case, highest values corresponded to TF. Probability of excluding wrong paternities, calculated from all the four loci together, varied between populations from 0.5798 to 0.7478.

Sujets

• Hormona del crecimiento
• Industria láctea
• Growth hormone
• Dairy farming

Informations

• Publié par: erevistas
• Publié le: 01 janvier 2001
• Nombre de lectures: 9
• Langue: Español

Extrait

AN LISIS ELECTROFOR TICO DE CUATRO LOCI DE
PROTEŒNAS S RICAS EN DIVERSAS POBLACIONES DEL PONI
VASCO-POTTOKA
ELECTROFORETIC ANALYSIS OF FOUR SERUM PROTEIN LOCI IN SEVERAL
POPULATIONS OF PONI VASCO-POTTOKA
1 2 1 2 1Arruga, M.V. , J.I. Intxausti , L.V. Monteagudo , I. Pascual y M.T. Tejedor
1Laboratorio de Citogen tica y Gen tica Molecular. rea de Gen tica. Facultad de Veterinaria. C/
Miguel Servet 177. 50013 Zaragoza. Espa a.
2Servicio de Ganader a de la Diputaci n Foral de Vizcaya. Lehendakari Aguirre etorbidea 2. 48014
Bilbao. Espa a.
PALABRAS CLAVE ADICIONALES ADDITIONAL KEYWORDS
Polimorfismo. Variabilidad gen tica. Œndices de fi- Polymorphism. Genetic variability. Fixation inde-
jaci n. xes.
RESUMEN
Se han analizado cuatro loci de prote nas s - puede considerarse que existe divergencia gen -
ricas (TF, GC, A1B y AL) en un total de 72 ponis tica significativa entre las poblaciones analiza-
vascos, correspondientes a cuatro poblaciones. das, no se ha detectado consanguinidad signifi-
Se han observado en TF un total de 7 alelos, si cativa dentro de las mismas. Por otro lado, se ha
bien TF*F y TF*F son muy raros y TF*E estuvo calculado el n mero de alelos efectivos y el PIC1 3
ausente de una de las poblaciones consideradas. para cada locus en cada poblaci n; en todos los
Los loci GC y AL fueron dial licos en todos los casos, los valores m s altos correspondieron a
casos. El locus A1B fue dial lico salvo en dos po- TF. La probabilidad de exclusi n de paternidades
blaciones; en una de ellas el alelo A1B*K estaba err neas, considerando los cuatro loci conjunta-
fijado y en otra aparec a el alelo A1B*F con muy mente, vari entre poblaciones, desde un valor
baja frecuencia. En todos los casos, se ha apre- m nimo de 0,5798 hasta un valor m ximo de
ciado equilibrio de Hardy-Weinberg. Se calcula- 0,7478.
ron para cada poblaci n la heterocigosidad ob-
servada y esperada, el porcentaje de
polimorfismo al 95 p.100 y al 99 p.100 y el n me- SUMMARY
ro medio de alelos por locus. El c lculo de los n-
Four serum protein loci (TF, GC, A1B and AL)dices de fijaci n medios mostr un valor no signi-
have been analysed in 72 poni vasco Pottokka in-ficativo para F (0,0379–0,0920, p>0,05),IS
dividuals, belonging to four populations. Sevenmientras que fueron altamente significativos los
TF alleles have been observed, but TF*F andvalores de F (0,1164–0,0693, p<0,01) y F 1ST IT
TF*F were rare and TF*E was absent from one(0,1499,–0,1352 p<0,01). De este modo, aunque 3
Arch. Zootec. 50: 7-13. 2001.ARRUGA, INTXAUSTI, MONTEAGUDO, PASCUAL Y TEJEDOR
of the considered populations. GC and AL were miten tener una idea de la situaci n de
diallelic loci in every case. A1B was a diallelic lo- mayor o menor aislamiento de estas po-
cus, except for two populations; in one of them blaciones, as como de las posibles rela-
A1B*K allele was fixed and in the other one ciones entre ellas.
A1B*F allele showed a very low frequence.
Hardy-Weinberg equilibrium was found in every
case. Observed and expected heterozygosity, MATERIAL Y M TODOS
percent of polymorphism (95 and 99 p.100) and
mean number of alleles per locus were calculated Hasta el momento actual, se han
for each population. The calculation of fixation analizado muestras de suero y de plas-
indexes showed a not significant value ma de un total de 72 Pottokas de dife-
for F (0.0379–0.0920, p>0.05), but FIS ST rentes localizaciones. Con el fin de al-
(0.1164–0.0693, p<0.01) and F (0.1499–0.1352IT canzar efectivos adecuados al an lisis
p<0.01) had highly significant values. Although
poblacional, se han considerado con-
we can consider that significant genetic divergen-
juntamente ejemplares procedentes de
ce exists among the analysed populations, signifi-
localizaciones muy pr ximas geogr fi-
cant consanguinity has not been detected in any
camente, entre las que se ha comproba-of them. On the other hand, number of effective
do la existencia de f ciles comunica-alleles and PIC have been calculated for each lo-
ciones, que permiten el intercambiocus and population; in every case, highest values
frecuente de material gen tico. As lacorresponded to TF. Probability of excluding
poblaci n 1 est formada por animaleswrong paternities, calculated from all the four loci
de Arma n (18) y de Escrita (4), latogether, varied between populations from 0.5798
poblaci n 2 por ejemplares proceden-to 0.7478.
tes de Arcentales (13) y de Herrera
(11) y la poblaci n 3 por individuos de
INTRODUCCI N Arboleda (6) y Ganer n (1), mientras
que la poblaci n 4 est constituida en
Con el fin de conocer un poco m s su totalidad por animales pertenecien-
profundamente la estructura poblacio- tes a la granja de la Diputaci n Foral
nal del poni vasco Pottoka se han ana- de Vizcaya.
lizado cuatro loci de prote nas s ricas Los loci proteicos analizados son
en diversas poblaciones de esta raza. los siguientes: transferrina (TF), prote -
As se han estimado las frecuencias na portadora de la vitamina C (GC), a-
g nicas, el n mero de alelos efectivos 1-b glucoprote na ( A1B) y alb mina
y el contenido de informaci n poli- (AL). Para el an lisis de los tres prime-
m rfica en cada uno de los loci y las ros se utiliza gel de poliacrilamida dis-
poblaciones estudiadas, lo que nos ha continuo como soporte de la electrofo-
permitido valorar la utilidad de estos resis (Gahne et al., 1977; Gahne y
an lisis en la detecci n de paternidades Juneja, 1978; Juneja et al., 1978). Se
err neas. utilizaron las t cnicas de Kristjansson
Por otro lado, tambi n se ha estima- (1963) y Krishnamurty et al. (1974)
do la consanguinidad en cada una de para el an lisis de la alb mina en gel
estas poblaciones y el grado de diver- de almid n.
gencia gen tica de las mismas, que per- Para el an lisis poblacional se ha
Archivos de zootecnia, vol 50, n m 189-190, p. 8.AN LISIS ELECTROFOR TICO DE PROTEŒNAS S RICAS EN PONI VASCO
utilizado el programa GENETIX (Bel- RESULTADOS Y DISCUSI N
khir et al., 1996-1998), que permite el
La tabla I muestra las frecuenciasc lculo de un conjunto de par metros
al licas, con sus correspondientespoblacionales (frecuencias al licas, pa-
errores est ndar, para los diferentesr metros de polimorfismo, ndices de
loci analizados en las cuatro poblacio-fijaci n F de Wright) y estudia su sig-
nes consideradas. Se han observadonificaci n estad stica mediante tests de
en TF un total de 7 alelos, si bienremuestreo (permutaciones).
TF*F , muy raro, s lo apareci enEl n mero medio de alelos efectivos 1
una de las poblaciones analizadas (po-para cada locus se ha estimado de
blaci n 4). Por otro lado, TF*E estuvoacuerdo con Crow y Kimura (1965). El
ausente de una de las poblacionescontenido de informaci n polim rfica
consideradas (poblaci n 3) y lo mis-(PIC) de un locus estima la calidad de
mo ocurri con TF*F en la poblaci neste marcador en estudios gen ticos, 3
3. Los loci GC y AL fueron dial licospuesto que mide el polimorfismo detec-
en todos los casos. El locus A1B fuetado. Se ha calculado de acuerdo con
dial lico salvo en dos poblaciones; enBotstein et al. (1980). La probabilidad
a priori de detectar una paternidad err - una de ellas el alelo A1B*K estaba fi-
jado (poblaci n 3) y en otra aparec anea mediante el uso de un marcador o
el alelo A1B*F con muy baja frecuen-conjunto de marcadores en pruebas de
cia (poblaci n 2). En todos los casos,exclusi n de paternidad se ha estimado
a trav s de las f rmulas de Jamieson se ha apreciado equilibrio de Hardy-
Weinberg.(1994).
La tabla II muestra que el locus TFLos par metros de polimorfismo
es el m s variante en t rminos de n -utilizados en este trabajo son los si-
guientes: heterocigosidad esperada en mero de alelos efectivos y PIC. La pro-
babilidad de exclusi n de paternidadessituaci n de equilibrio de Hardy-Wein-
err neas para cada poblaci n, conside-berg, corregida para el sesgo de mues-
treo (Hexp, Nei, 1978), heterocigosi- rando globalmente los 4 loci analiza-
dad observada (Hobs), proporci n de dos, oscila entre 0,5798 (poblaci n 3)
y 0,7487 (poblaci n 2). Estos valoresloci polim rficos donde la frecuencia
ponen de manifiesto la utilidad de es-del alelo m s frecuente es 0,95
(P(0,95)), idem para 0,99 (P(0,99))y tos marcadores en pruebas de exclu-
n mero medio de alelos por locus si n de paternidad, como un primer
(A/l). test r pido y barato que permite des-
Los ndices de fijaci n o estad sti- cartar muchos casos dudosos, de mane-
cos F (F , F y F ; Wright, 1965, ra que s lo se deber an aplicar pruebasIS IT ST
1978) se han calculado mediante las m s costosas (an lisis de microsat li-
f rmulas de Weir y Cockerham (1984). tes, por ejemplo) en los casos en que
El error est ndar de estos par metros se todav a persistan dudas sobre la pater-
ha estimado por remuestreo seg n el nidad de un individuo.
m todo de jacknife sobre los loci (Weir, La tabla III muestra los ndices de
1996). variabilidad gen tica de las diversas
Archivos de zootecnia, vol 50, n m 189-190, p. 9.ARRUGA, INTXAUSTI, MONTEAGUDO, PASCUAL Y TEJEDOR
poblaciones, considerando globalmente rresponde a la poblaci n 3, mientras
los 4 loci analizados. Como puede que la poblaci n 2 aparece como la
apreciarse, la menor variabilidad co- m s variante.
Tabla I. Efectivo analizado y frecuencias al licas con sus correspondientes