M2 Ecologie Evolution Biometrie UE Description Statistique des Structures Biologiques
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Niveau: Supérieur, Master, Bac+5
M2 Ecologie,Evolution,Biometrie UE Description Statistique des Structures Biologiques Composante spatiale de la variabilite des formes d'humus en fonction du type de peuplement Hugues Santin-Janin Probleme pratique de statistique dssb08 Table des matieres 1 Introduction 2 2 Objectif 2 3 Definition et nomenclature des formes d'humus 3 4 Donnees 3 4.1 iden . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 4.2 peup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 4.3 desc_iden . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 4.4 hori_qual . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 4.5 hori_quant . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 4.6 fact_bio . . . . . . . . . . .

  • peuplement pur

  • pied par pied

  • problematique statistique

  • identifiants des releves

  • beech-hornbeam forest

  • horizon

  • peuplement mixte

  • pure beech

  • ordonnees en metres des releves dans la placette


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Langue Français
´ ´ M2Ecologie,Evolution,Biome´trie UE Description Statistique des Structures Biologiques
Composantespatialedelavariabilite´desformes d’humus en fonction du type de peuplement
Hugues Santin-Janin
Proble`mepratiquedestatistiquedssb08
Tabledesmatie`res 1 Introduction2 2 Objectif2 3De´nitionetnomenclaturedesformesdhumus3 4Donn´ees3 4.1iden. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .3 4.2peup4. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.3desc_iden. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4 4.4hori_qual4. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.5hori_quant4. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.6fact_bio. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .5 5 Questions5 R´ef´erences5
1
Hugues Santin-Janin
1 Introduction Toutcequisuitestexplicit´edansunarticledeMicha¨elAubertet al. (2006)[2].Lesdonn´eessontcommunique´esparlegroupederechercheECODIV, UPRES-EA1293,Universite´deRouenquienautoriselacc`es.Ontrouverades d´etailsdanslath`esedupremierauteur[1]. Lese´tudesportantsurladynamiquedelamati`ereorganiquedanslessols constituentdesaxesderecherchesprivil´egie´senSylviculture.Eneet,unfort tauxdede´compositionetdemin´eralisationdelamatie`reorganiqueausein delepisolumhumife`reame´liorelacroissancedesarbresetlaproductivite´a` longtermedespeuplementsvialaremise`adispositiondes´ele´mentsnutritifs immobilise´sdanslesliti`eres. Lespropri´et´esdeshorizonsorganiquesdusol,sontconditionn´eesparleses-sencesquicomposentlepeuplement,etparleursre´partitionspatialeausein decelui-ci.Celaestli´eaufait,quelacompositionchimiquedesfeuillesdie`re conside´rablemententreesp`eces,etparconse´quent,modielavitesseded´ecom-positionetlaqualit´edelhumus.Parexemple,onsaitquelaliti`ereduCharme (Carpinus betulusrt(eHueˆlldeuecet´equaliureqelliemedtse)Fagus Sylvatica) i.e.Carbonne/Azote(C/N),lignine/Nplusfaibles.Elleestplusfacilementde´-grade´eparlesorganismesdusol.LeCharmeestconside´re´commeuneespe`cedite `aitleri`ae´mleoiartnensseit,edeadnhsCurnapeem,upslementmixtedeH.ˆeitAr lespropri´et´eschimiquesdesfeuillesdeCharmessontsusceptibles(i)dame´liorer lad´ecompositionauseindelepisolumhumif`ereet(ii)dintroduire,enfonction delar´epartitionspatialeduCharme,unevariabilit´eauseindelepisolum. Face`aceconstat,lenjeu`atermepourlessylviculteurs,estded´eterminerles conditions de plantation des peuplements mixtes (par bouquets, pied par pied...), quimaximisentlesb´ene´cesentermedequalite´dhumus,li´es`alapr´esenceet a`lare´partitiondesesp`ecesa`ae´m`ireltierantelioe`erslelmeespdeaunplitintsa demauvaisequalit´e.
2 Objectif Lebutprincipalestded´eterminerlinuencedelacompositiondelacanope´e surlavariabilite´desformesdhumus`al´echelledupeuplement.Plusparticu-lie`rement,ilsagitdecaract´eriserlh´ete´roge´ne´ite´spatialedelavariabilite´des formes d’humus en fonction du type de peuplement. Pour ce faire, nous compa-ronslaqualite´delhumusentreunpeuplementpur(Hˆetre)etunpeuplement mixte(70%Heˆtre,30%Charme). Oncherche`atesterquatrehypoth`eses: 1.Lavariabilite´desformesdhumusestplusgrandesousunpeuplement mixte, que sous un peuplement pur. 2. L’humus est en moyenne plus actif sous un peuplement mixte, que sous un peuplement pur. 3.Lhe´te´roge´ne´ite´desformesdhumusestplusgrandesousunpeuplement mixte, que sous un peuplement pur. 4.Leetam´eliorantdelalitie`reduCharme,estlimit´e`aladistributionde salitie`re,etnediusepasdansleszonesdomin´eesparleheˆtre.
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2.7.0(2008-04-22)dssb08.rnwPage2/5Compile´le2008-05-07 S. Penel, URL :http://pbil.univ-lyon1.fr/R/pps/dssb08.pdf
Hugues Santin-Janin
3De´nitionetnomenclaturedesformesdhu-mus Selonlenouveaure´fe´rentielpe´dologique[3],leshorizonsdesolscontenantde lamati`ereorganique(gure1)peuventeˆtredivis´esen(i)horizonsholorganiques (horizonsO)pratiquementsansmat´erielmin´eral,et,(ii)enhorizonsorgano-min´eral(horizonA)en-dessous.LeshorizonsOpeuventˆetredivis´esentrois types,selonledegre´detransformationdeleurliti`ere: OLenemnttiraspqutiarfenemgetcadtescfeuelielmoop´sde.Cetboistsde horizonpeuteˆtredivise´en(i)OLn,compose´dunelitie`redemoinsdun annond´ecompos´ee,et(ii)OLv,compose´duneliti`eredeplusdunan, dontlacolorationachange´,etdontlacohe´sionachang´e,souslactionde champignons. OFmgnest´vtetifsarlangedepedunm´emoc´sopere`itaMaelcdve,auxta´eeg OrganiqueFine(MOF),r´esultantdelaccumulationdeboulettesf´ecales. SelonlepourcentagedeMOF,cethorizonpeuteˆtredivise´enOFr(moins de 30% de MOF) et en OFm (30-70% de MOF). OHdeMOe70%lusdedepna`topdnrrse,Focndioatulumccaal-uobeomcs´po lettesfe´calesetdepetitsfragmentsdev´ege´taux.Cethorizonpeuteˆtre divis´eenOHr(70-90%deMOF)etOHf(90-100%deMOF).
4Donne´es Lesdonne´esformentunelistedanslechierdssb08.rda. Pour s’en servir : load(url("http://pbil.univ-lyon1.fr/R/pps/dssb08.rda")) names(dssb08) [1] "iden""peup" "desc_iden""hori_qual" "hori_quant""fact_bio" sapply(dssb08, nrow) iden peupdesc_iden hori_qualhori_quant fact_bio 242 242 242 242 242 242 sapply(dssb08, ncol) iden peupdesc_iden hori_qualhori_quant fact_bio 3 1 514 11 11 121 descriptions macro-morphologiques et chimiques (pH, C/N de l’horizon A) ont´et´eeectue´sdanschaquetypedepeuplementpendantlhiver2000-2001. Cesdescriptionsont´et´er´ealise´es`alaidedunegrillede´chantillonnagere´gulie`re de100mdecote´avecunemaillede10m.Ontrouveradoncles121pointsdun site(11x11)puisles121points(11x11)delautre).Lesvariablessontrange´es par blocs.
4.1iden Lesidentiantsdesreleve´ssont: codesrslevee´42chrde2cteu:vee`tcaracedsenıˆaletsanintdesire X:bAcs`etresdeissesenmnadspalslerse´vecelaett Yenm`´eessdesetre´vseerelallpadsnteetacOr:nndo library(ade4) X <- dssb08$iden[, 2:3] s.label(X[1:121, ], lab = dssb08$iden$code[1:122], clab = 0.75)
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