Prog cours PhysiopathCM 2006

Raphaele.Burgmann

Description

UNIVERSITE LOUIS PASTEUR MASTER VIE ET SANTE PROGRAMME DES COURS Spécialité PHYSIOPATHOLOGIE CELLULAIRE ET MOLECULAIRE Domaine : Sciences Master Mention Vie et Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire Responsables pédagogiques du master : Dr G. Prévost Pr S. Bahram UPRES EA-3432, Institut de Bactériologie Centre de Recherches d’Hématologie de la Faculté de Médecine, et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 3 rue Koeberlé, 4 rue Kirschleger, F-67000 Strasbourg. F-67085 Strasbourg cedex Tel : [phone] Tél. : [phone] Fax : [phone] Fax : [phone] E-mail : [e-mail] E-mail : siamak@hemato-ulp.u- strasbg.fr Pré-requis (exemples de cours) : • Bases académiques indispensables Biologie cellulaire et moléculaire, éléments de physiologie • Types de profil admis dans cette formation Licences de Biologie, Biologie cellulaire, et Physiologie Licences de Biochimie et Biologie Moléculaire Les dossiers extérieurs à l’ULP seront évalués par la commission pédagogique (Juin, juillet, septembre de chaque année) Masters 2 accessible depuis ce Master : Biologie Cellulaire Intégrée (de plein droit), d’autres spécialités sur examen des dossiers en fonction des options validées par le candidat. PROGRAMME DES COURS - UNIVERSITE ...

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Extrait

             

     

    UNIVERSITE LOUIS PASTEUR

MASTER VIE ET SANTE

PROGRAMME DES COURS         Spécialité  

PHYSIOPATHOLOGIE CELLULAIRE ET   MOLECULAIRE               

Domaine : Sciences   Master Mention Vie et Santé       Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire         Responsables pédagogiques du master :   Dr G. Prévost Pr S. Bahram    UPRES EA-3432, Institut de Bactériologie Centre de Recherches d’Hématologie de la Faculté de Médecine, et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 3 rue Koeberlé, 4 rue Kirschleger, F-67000 Strasbourg. F-67085 Strasbourg cedex    Tel : [phone] Tél. : [phone] Fax : [phone] Fax : [phone]   E-mail :[e-mail] : E-mailu. -  siamak@hemato-ulp strasbg.fr  

          Pré-requis (exemples de cours) : • Bases académiques indispensables Biologie cellulaire et moléculaire, éléments de physiologie   • de profil admis dans cette formation Types Licences de Biologie, Biologie cellulaire, et Physiologie Licences de Biochimie et Biologie Moléculaire     ’ Les dossiers extérieurs à l ULP seront évalués par la commission pédagogique (Juin, juillet, septembre de chaque année)       Masters 2 accessible depuis ce Master : ’ Biologie Cellulaire Intégrée (de plein droit), d autres spécialités sur examen des dossiers en fonction des options validées par le candidat.  

PROGRAMME DES COURS - UNIVERSITE LOUIS PASTEUR   MASTER VIE ET SANTE –   Spécialité PHYSIOPATHOLOGIE CELLULAIRE ET MOLECULAIRE   Vingt cinq unités de recherche (INSERM, CNRS, EA) soutiennent cette formation multidisciplinaire à la recherch ’ e médicale sur les thèmes de la  cancérologie, la génétique humaine, l immunologie, la microbiologie médicale, et de la biologie et médecine de la reproduction. La formation développe la transversalité, la communication scientifique et le rapprochement rapide vers le monde de la recherche avec des e ’ xpériences pratiques en laboratoires permettant aux étudiants  d acquérir une vision précise et dynamique des possibilités de recherche et des approches nécessa ’ ires pouvant répondre aux probléma ’ tiques  ’ de  la Santé Humaine. Loin d être un enseignement médical, il s agit d un enseignement fondamental axé sur la biologie humaine et ses mécanismes pathologiques. La formation Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire est adaptée aux étudiants scientifiques, médecins, pharmaciens ou dentistes.       BILAN d’exercice   ’ Nombre d inscrits 2005-2006 M1 : 87 inscrits, soit 57 IA dont 19 étudiants scientifiques + 30 IP ; M2 : 23 étudiants (9 étudiants du secteur Santé)     Résultats sessions 2006 : M1 : 17 reçus (étudiants scientifiques) en juin / 19 reçus définitifs. Le cas des étudiants du secteur Santé est particulier puisque validant M1 sur plusieurs années ; 68 étudiants du secteur Santé se sont inscrits, 54 étudiants ont validé de 3 à 30 crédits au cours de 2005-2006, 17 étudiants sont désormais titulaires du Master Vie et Santé, spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire au titre de 2005-2006.     M2 : 16 reçus en juin, 23 reçus définitifs. ’ 11 étudiants continuent en thèse, 2 étudiants se réorientent vers d autres Masters, 2 étudiants changent de voie, 1 étudiant e ’ st en recherche de  thèse ; 7 étudiants du secteur Santé poursuivent d abord leur formation professionnelle, 2 sont inscrits en thèse, 3 au moins envisagent une thèse ensuite.   ’ Nombre d inscrits 2006-2007 M1 : >95 inscrits, soit > 66 IA dont 20 étudiants scientifiques, + 29 IP ;    mais projection > 100 inscrits M2 : 23 étudiants (7 étudiants du secteur Santé).

  MASTER   PHYSIOPATHOLOGIE CELLULAIRE ET MOLECULAIRE       OPTION CANCEROLOGIE   [e-mail] ;r.fel.KURTZJ-Emmanuarbsuogrc@rh-uts      [e-mail]      Calendrier Intitulé du cours Enseignant cture et organisation du génome Me 27.09.06 13h30 Réplication de llaluel ce ir te NDA’noisi u v r i t d S D. BURNOUF Me 27.09.06 15h05  du cycle cellulaire Régulation J-P. BERGERAT Me 27.09.06 17h15  et maturation de l’ARN Structure J. STEVENIN      Je 19.10.06 17h00  de la transcription Régulation J-M. EGLY   I.    Biologie moléculaire de  Lu 02.10.06 8h00 Physiologie des récepteurs nucléaires D. MORAS      la  1 ce   llule  Me  04.10.06 14h00 t  erseuptceRé   sed noitcudsnart mitogèn signaux itrplofi see  t naatérs if B. WASYLYK 6h00  Me  04.10.06 16h10 ou sesult  eeschlleC   es. rantlatiRéguluseeclliléfp or iancontiel clalu d no al  e fid eréfri e L. MAUVIEUX      Me 11.10.06 14h00 erialullec enarbem   Mrisearanembmarsnts tsportran et  lul eritrinelacra   Tc fi N. BOEHM a Me 11.10.06 15h05 luia snoi tedA  é iséhs onllceernttiac  ,Ch   ptgyascoouqleteet mobilitytose et E. GUERIN res Me 11.10.06 17h15 Mécanismes de l’apoptoseJ. CERALINE

     

Date 1h30 2h00 1h30   2h00   2h00   2h00 1h00   1h00 2h00 1h00

   

   

 

II. Mécanismes de la cancérogenèse    14h00

III. Biologie de la progression tumorale   11h30

Calendrier Me 18.10.06 14h00   Me 18.10.06 16h10     Je 28.09.06 17h00   Me 25.10.06 14h00   Me 25.10.06 16h10     Me 08.11.06 14h00 Me 08.11.06 15h05   Me 08.11.06 17h15  

Calendrier Me 15.11.06 14h00 Me 15.11.06 16h10     Je 16.11.06 17h00     Me 22.11.06 14h00   Me 22.11.06 15h05 Me 22.11.06 16h10   Me 22.11.06 17h15    

Intitulé du cours Enseignant Date Surveillance de l’intégrité du génome T. LAVAUX 2h00 Transformation cellulaire et histoire naturelle des J-P. BERGERAT 2h00 cancers      dommages dans   2h00 l' M A é D ca N  ni e s t  m m e a s l   a d d e i   e r s é   p g o é n n s ét e i   q c u el e l s u   l a ai s r s e o  a ci u é x e   s  F. DANTZER      Cancérogenèse virale F. STOLL-KELLER 2h00 Hormones et cancérogenèse (sein/utérus) P. BRETTES 1h30      Biologie moléculaire des leucoses myéloïdes L. MAUVIEUX 1h00 Syndromes de prédisposition héréditaire au cancer J-M. LIMACHER    2h00 F M a o c d t i e fi u c r a s t   i e o n n v s i   r é o p n ig n é e n m é e ti n q t u a e u s x     et cancérogenèse  J. CERALINE 1h30

Intitulé du cours Enseignant Date Les étapes de la progression tumorale chez l’homme : des lésions pré-cancéreuses à la métastase : aspectsM-P. CHENARD 2h00 anatomo-pathologiques et moléculaires Biologie de l’angiogenèse tumorale C. KLEIN-SOYER 1h00      Biologie de l’invasion et de la métastase   M-C. RIO 2h00      Cytogénétique tumorale P. LESSARD 1h30 hénotypage moléculaire dans le I d m ép p i li s c t a a t g io e, n  l s e     d p u r   o p nostic et le traitement des cancers  M-P. GAUB1h00 ns génétiques au cours de l’initiation et de la p A r lt o é g r r a e ti s o sion tumorale  J. ABECASSIS 1h00 Antigènes tumoraux et immuno-surveillance M. RADOSAVLJEVIC 1h00     

       

IV. Recherche en thérapeutiques  anticancéreuses    12h30

Calendrier Intitulé du cours Enseignant Me 29.11.06 14h00 Chimiothérapies cytotoxiques B. DUCLOS   Radiothérapie   effets biologiques des radiations - Me 29.11.06 16h10 oi ned sfeefst t  ntes : optimisat albie egop ttnetrahéutpeueiq cs,itasilai   asinoi G. NOEL on - effets biologiques et développement des rayonnements particulaires      Hormonothérapies : interactions avec les autres voies Me 06.12.06 14h00 signalisation cellulaire et nouvelles orientations deJ. CERALINE thérapeutiques Me 06.12.06 16h10 Mécanismes de résistance aux agents anti-cancéreux I. LELONG      Développement thérapeutique : Me 13.12.06 14h00   • génique Thérapie J-M. LIMACHER • cellulaire Thérapie • Vaccinations anti-tumorales Me 13.12.06 16h10 mentoppeével   D V   caicanitno sna  thérapeutique : onal ,em)VPH  -ttiorumesalMé (ADFUB   LA  SKER LIPJ-J. et .D      re et nouveaux traitements Me 20.12.06 14h00 • ntica écolaiullaib mgeC   xuerécna J-E. KURTZ Biologie de la progression tumorale  Me 20.12.06 16h10Biologie moléculaire des sarcomesJ-E KURTZ (suite et fin)   Cours : 6 crédits TP en laboratoire de recherche (35h) : 3 crédits

Evaluation Ecrit 3 h      Rapport Tech   

Date 2h 2h   2h 1h   2h 1h30   2h 2h00

Unité d’Enseignement GENETIQUE HUMAINE (Pr H. Dollfus) [e-mail]      Lieu des cours : salle 19 d'Anatomie Pathologique – Hôpital Civil (entrée à l'arrière du bâtiment)     Vendredi 29 septembre de14.00 à 16.00 Introduction générale au M1 de génétique humaine. H. DOLLFUS : de 16.00 à 18.00de nombre et de structure (I). E. FLORI: Caryotype normal  Anomalies cytogénétiques   Vendredi 6 octobre   de 14.00 à 18.00: Le diagnostic moléculaire des maladies monogéniques. M. COSSEE, V. BIANCALANA   Vendredi 13 octobre de 14.00 à 16.00cytogénétiques de nombre et de structure (II). E.: Caryotype normal  Anomalies FLORI de 16.00 à 18.00: Syndrome microdélétionnel (I). E. FLORI     Vendredi 20 octobre de 14.00 à 16.00: Syndrome microdélétionnel (II). E. FLORI de 16.00 à 18.00: CGH sur chromosomes. S. DUMANOIR   Vendredi 27 octobre de 14.00 à 16.00: Ataxies et paraplégies spastiques héréditaires et mitochondriopathies : aspects cliniques et pathologiques. C. TRANCHANT de 16.00 à 18.00: Ataxies et paraplégies spastiques héréditaires et mitochondriopathies : aspects génétiques et moléculaires. M. KOENIG     Vendredi 3 novembre de 14.00 à 16.00: Diagnostic pré-implantatoire et biologie moléculaire. C. MOUTOU de 16.00 à 18.00: Cytogénétique Moléculaire et DPI par FISH. P. GOSSET   Vendredi 10 novembre de 14.00 à 16.00: Démences héréditaires, Parkinson héréditaire et chorée de Huntington : aspects cliniques et pathologiques. C. TRANCHANT de 16.00 à 18.00: Biochimie du Vieillissement. N. DALI-YOUCEF   Vendredi 17 novembre de 14.00 à 16.00: Démences et Parkinson héréditaires : aspects génétiques et moléculaires. M. KOENIG de 16.00 à 18.00de Huntington et ataxies dominantes. D. DEVYS: Maladies à polyglutamnies : chorée   Vendredi 24 novembre de 14.00 à 16.00: Anomalies de développement des membres. B. DORAY de 16.00 à 18.00 Liaisons Génétiques. M. KOENIG :   Lundi 27 novembre de 8.00 à 10.00 : Ciliopathies. Génétique et Rétinopathies. H. DOLLFUS  

Vendredi 1 er décembre   de 14.00 à 16.00: Pathologiesdes CDG syndromes et pathologies du métaboliques de l'enfant, exemple développement liées au métabolisme du cholestérol. B. DORAY de16.00 à 18.00: Situations classiques du conseil génétique et difficultés éthiques liées au diagnostic des maladies génétiques. E. FLORI, B. DORAY, H. DOLLFUS   Vendredi 8 décembre de 14.00 à 16.00: La thérapie génique. H. PUCCIO   de 16.00 à 18.00: Inactivation de l'X. M. COSSEE   Lundi 11 décembre de 8.00 à 10.00: Craniosténoses et FGFR. F. PERRIN-SCHMITT, B. DORAY   Vendredi 15 décembre de 14.00 à 18.00: Génétique multifactorielle. J.L. MANDEL   Livre recommandé : Atlas de poche de génétique 2ème édition.PASSARGEE. ; Editeur :FLAMMARION MEDECINE SCIENCES. Collection :Atlas de poche Flammarion   Date de parution : 15/01/2003, 250 illustrations - 478 pages. ISBN : 2 257 121163 Lieux de cours : Salles 19 / 23 de lInstitut dAnatomie Pathologique, HUS  Campus médecine   Cours : 6 crédits TP en laboratoire de recherche (35h) : 3 crédits   Evaluation Ecrit 3 h       

Rapport Tech

1 ’ M1 – semestre Unité d enseignement TD de BioInformatique Acquisitions de données expérimentales et banques de données (3crédits - 3 ects) . G. Prévost, C. Le Brun, P. Riegel   Gilles Prévost(MCU-PH). Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : [phone]. Fax : [phone]. Email :[e-mail])     Séance 1 - 28.09.2006 8h 10h30. Reherches documentaires PubMed (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/), scd (http://www-scd-ulp.u-strasbg.fr/ ) et valeur dune recherche. Recherche de séquences nucléotidiques, reprise sous format FASTA, comparaisons BLAST   Séance 2  05.10.2006 8h  10h00. Recherche de motifs dans les séquences nucléotidiques, sites de restrictions (thpt/:t/oo.ceb.nlscuEB/Nomni/2rettphp.xed), traduction en protéine. Sensibilisation au site http://www.expasy.org/tools/   Séance 3  09.10.2006 8h  10h00. Séquençage, rabouttage de fragments séquencés, repérage de mutations, contigs   Séance 4  12.10.2006 8h  10h00. Multi-alignements de séquences nucléotidiques, applications à la phylogénétique (P. Riegel)   Séance 5  19.10.2006 8h  10h00. Contrôle continu court. Etude des protéines, recherche de paramètres physicochimiques sur http://www.expasy.org/tools/   Séance 6  26.10.2006 8h  10h00. Etudes des protéines, recherche de paramètres physicochimiques, alignements, recherche de motifs.   Séance 7 - 02.11.2006. 8h00  10h00. Etude des protéines. Multi-alignements, recherche de motifs.   Séance 8.- 15.11.2006. 8h00  10h00. Contrôle continu court. Structure des Protéines I. PDB database, WebLab Viewer, PyMol, RasMol. Visualisation des structures, remplacement de résidus, distances atome-atome, charges organisation structurale dune protéine   Séance 9 - 16.11.2006. 8h00  10h00. Structure des Protéines II   Séance 10.- 20.11.2006. 8h00  10h00. Structure des protéines III   Séance 11  23.11.2006. 8h00  10h00. Acquisition et traitement de données numériques II sur SigmaPlot 10   Séance 12  30.12.2006 8h30  10h30. Contrôle terminal    

Evaluation

2 Cont Continus + 1 cont terminal : 3 exercices    

M1 - second semestre Unité d'Enseignement "Technologies de la Biologie Cellulaire et Moléculaire" Y. Piémont - B. Jaulhac Yves Piémont(PU-PH) Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : [phone]. Fax : [phone]. Email :[e-mail])   Benoît Jaulhac(PU-PH) Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : [phone]. Fax : [phone]. Email :[e-mail])   Cours - conférences sur les principes, applications et limites des Techniques en Biologie Moléculaire et Cellulaire     1- Enzymes de la Biologie Moléculaire / séquençage d'ADN- G. Prévost (9-12h00) 29-09-2006 2- Polymérases thermostables et applications - B. Jaulhac (9h00 - 11h00) 06-10-2006 3- Purification des protéines et marquages - G. Prévost (9h00-11h00) 13-10-2006 4- Vecteurs et systèmes d'expression procaryote/eucaryote - Prof A. Pereira (9h00-11h00)  20-10-2006 5- Cultures cellulaires  P. Simon-Assman (9h00-11h00) 27-10-2006 6- Cytométrie en flux  A.S. Korganow (9h00-11h00)02-11-2006 7 Techniques d'étude de l'apoptose - F. René (9h00-11h00) 17-11-2006 - 8- Contrôle transcriptionnel chez les Eucaryotes L. Tora (8h30-10h30) 21-11-2006  9- Protéomique (SELDI-Tof) - M.C. Rio (8h30-10h30) 24-11-2006 10- Transgenèse  N. Ghyselinck (10h30-12h30) 24-11-2006   Ouvrage conseillé : Principes de biologie moléculaire en biologie clinique. Ameziane, Bogard, Lamoril. Editions Elsevier –Campus Référence ISBN2-84299-685-2   -Ces conférences feront lobjet dun examen écrit (15.12.2006, 10h00-11h30).   Exposés sur les démarches scientifiques (20 et 22.12.2006, matinées)   Les conférenciers ci-dessus proposent quatre à six articles liés au thème traité. Deux articles développant des techniques semblables ou parallèles seront remis à chaque étudiant. Les étudiants auront un délai de deux mois environ pour produire un résumé technologique (10 min) des articles distribués (tirage au sort ? 30.03 et 06.04) présenté si possible avec un support PW Point. Deux à trois questions de compréhension ou de regard critique sur les approches technologiques pourront ensuite leur être posées par le Jury (3-4 personnes les 04.05 , 11.05 , 18.05.2006). Un résumé de 2-3 pages sera également rendu pour étayer largumentaire (schémas bienvenus). Un membre au moins sera commun dune séance de Jury à lautre. Laudition des exposés est possible pour les étudiants du M1 Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire. Par ailleurs, la seconde partie de cet enseignement consiste pour les étudiants à réaliser un résumé "technologique" suivi d'un article (10 min orale), les intervenants devront nous envoyer, à G. Prévost ou à M le Pr Benoit Jaulhac, 2 ou 3 articles afférant avec les sujets développés. Les exposés se déroulant fin décembre (21 et 22-12-.2006), il serait souhaitable de nous envoyer ces articles avant le 15.10.    

Evaluation

Résumé-    01 vidni 5+ ir tcE h103 Expoech sé T    min

U.E. Stratégies de Recherche sur la Cellule  2006-2007 S1 M1     Anne-Catherine SCHMIT Institut de Biologie Moléculaire des Plantes [e-mail]   Master Vie et Santé     Cours à l’Amphi 2 Institut LeBel : Cours Magistraux :        A.C. SCHMIT: (5h)Les supports du transport nucléo-cytoplasmique   et leurs rôles en mitose(2 octobre, 9 octobre, 16 octobre)   J. De MEY :   La protéine APC (AdenoPolyposis Coli) dans le (6h) cancer du colon(6 Novembre, 13 Novembre et 20 Novembre)   J.L. IMLER:NF-κB dans la signalisation de l’immunité innée    (5h) (27 Novembre, 4 Décembre et 11 décembre)     Programme des TP/TD : entre le 16.10 et le 10.11, salle 154H du Le Bel   E. HERZOG/M.C. CRIQUI:Expression transitoire(2x4h) de protéines à NLS dans des cellules BY-2   Analyse darticles scientifiques(2h) G. MIREY:Culture de cellules animales (modèle : cellules   S2 de Drosophile) (2x4h) Analyse darticles scientifiques(2h)   Comme l'an dernier les étudiants de physiopathologie cellulaire et moléculaire auront leurs TP/TD de SRC lasemaine 45(les lundi, mardi, mercredi et jeudi matins du 6 au 9 Novembre de 8h à 12h).Rien le vendredi   Gladys Mirey prends les créneaux des lundi et jeudi, Etienne Herzog celui des mardi et mercredi. ______________________________________________________________________________   Anglais CRL, Pr P. Acker et P. Candas 3, CRL - 6ème étage, rue Humann Bâtiment -   ETUDIANTS en M1 Volume d'enseignement nominal pour les étudiants devant valider 6 ects d'anglais, soient les étudiants d'origine scientifique, étudiants étrangers : 6 x 2 h encadré + 6 x 2 h accès libre dans les créneaux indiqués / semestre (= 3 ects / semestre) évaluation 1er semestre : expression orale + questions : faire le bilan de votre formation, besoins initiaux, difficultés et solutions trouvées, progrès réalisés et à réaliser liés à la pratique de l'anglais, et dans le cadre de votre formation évaluation 2nd semestre : compréhension écrite, expression écrite (?), compréhension orale, expression orale NB: une fiche de suivi (présence + type de travail) sera remplie à chaque passage, accès libre aux étudiants de Master les jeudis de 10h à 12h POUR TOUS LES ETUDIANTS : possibilité d'entretien de l'anglais lors des créneaux "accès libre", se renseigner Cas des étudiants de DCEM-1 : valider l'anglais dans le cursus médical   Cas des étudiants > DCEM-1 : possibilité de - valider 2 x 6 h d'anglais encadré / semestre sur engagement volontaireet/ou possibilité d'entretien de l'anglais lors des créneaux "accès libre", se renseigner Etudiants en M2 intéressés et étudiants > DCEM-2 : rencontre avec Mme Candas le jeudi 29 septembre à 18h au CRL