Rapport de Mission Pr D Raoult
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Rapport de Mission Pr. D. Raoult 130 EN MATIERE DE RECHERCHE

  • earth science

  • financement de la recherche en maladies infectieuses dans le cadre

  • multiples sources de financement

  • source ost

  • recherche médicale

  • maladie infectieuse

  • données men-dpd

  • financement

  • politique active des présidents clinton


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Exrait

Fiche TD avec le logiciel :ter3 Lecouplagedetableauxe´cologiques S. Dray, D. Chessel
Cettecheillustrelutilisationdesprincipalesme´thodesdecouplage en´ecologie.Ellesappuieessentiellementsurlutilisationdupaquet ade4.
Tabledesmatie`res 1 Introduction 2 1.1 Ordination directe et indirecte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 1.2 Juxtaposition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 1.3 Croisement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 2Analysecanoniquedescorr´elations5 2.1 Analyse discriminante . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 2.2 Analyse factorielle des correspondances . . . . . . . . . . . . . . 8 3 Analyses sur variables instrumentales 8 3.1 Analyse des redondances . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 3.2 Analyses inter et intra-classes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 3.3 Analyse canonique des correspondances . . . . . . . . . . . . . . 15 3.3.1 Analyse discriminante . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 3.3.2Moyennesr´eciproquesetre´gression.............17 4 Analyse de co-inertie 19 Re´f´erences23
1
S. Dray, D. Chessel
1 Introduction Onconsid`ereuntableauY(nxs) avec l’abondance desnsseesdap`ecnsites. Undeuxie`metableauXcontient les mesures depseneivornnmeneatles`albairav nesnianylnadtudsiripleuxtetssites.Chaqateuaelbueputeˆttrret´aiarepeaun d’analyse simple (X,Q1,D) et (Y,Q2,D). Ilyatroisstrat´egiesprincipalesdassociationdedeuxtableaux.Ellesre-couvrent,a`causedesnombreuxjeuxdeparam`etres,unvasteensemblede pratiques. Il suffit de saisir ces trois principes pour faire un choix, voire pour construire des associations originales dont on peut avoir besoin. Lecouplagededeuxtableauxdedonne´esestuneop´erationfondamentaleen e´cologiestatistique.Ondisposedune´enormelitt´tusurlesujet.Parmiles era re baseshistoriquesondoitrappelerquelquesope´rationsfondamentales. 1.1 Ordination directe et indirecte En face du tableauYqu,euipettˆsore,noitanidrodeodth´eemun`aisum onretrouvedelinformationme´sologiquecontenuedansletableauX. Deux strat´egiessontenvisageables[Jongmanetal.,1987]: 1.uneordinationdirectedesreleve´setdesesp`eceslelongdu(oudes)gra-dient(s) de variables environnementales. 2.uneordinationdesrelev´esselonleurcompositionsp´ecique,suiviedune interpr´etationdur´esultatobtenua`lalumi`eredeconnaissancesexte´rieures surlesespe`cesoulessites. Whittaker[1967]qualiecesdeuxstrat´egies,respectivement,direct gradient analysisetindirect gradient analysis.
1.2 Juxtaposition Deuxtableauxayantlesmˆemeslignessontsimplementaccol´espourformer un nouveau tableau qui appelle une analyse simple.
LogicielRversion2.10.0(2009-10-26)ter3.rnwPage2/24Compile´le2009-11-18 Maintenance : S. Penel, URL :tth-vylu.inbpli:p///pdffr/Ron1./ter3.pdf
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