Rapport de Mission Pr D Raoult

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Rapport de Mission Pr. D. Raoult 130 EN MATIERE DE RECHERCHE

• earth science


• financement de la recherche en maladies infectieuses dans le cadre


• multiples sources de financement


• source ost


• recherche médicale


• maladie infectieuse


• données men-dpd


• financement


• politique active des présidents clinton

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• United States
• Institut national de la santé et de la recherche médicale
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• Recherche médicale
• Maladie infectieuse

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• Publié par: profil-urra-2012
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• Langue: Français

Extrait

Fiche TD avec le logiciel : ter3 ————— Lecouplagedetableauxe´cologiques S. Dray, D. Chessel —————

Cetteficheillustrel’utilisationdesprincipalesme´thodesdecouplage en´ecologie.Elles’appuieessentiellementsurl’utilisationdupaquet ade4.

Tabledesmatie`res 1 Introduction 2 1.1 Ordination directe et indirecte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 1.2 Juxtaposition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 1.3 Croisement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 2Analysecanoniquedescorr´elations5 2.1 Analyse discriminante . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 2.2 Analyse factorielle des correspondances . . . . . . . . . . . . . . 8 3 Analyses sur variables instrumentales 8 3.1 Analyse des redondances . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 3.2 Analyses inter et intra-classes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 3.3 Analyse canonique des correspondances . . . . . . . . . . . . . . 15 3.3.1 Analyse discriminante . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 3.3.2Moyennesr´eciproquesetre´gression.............17 4 Analyse de co-inertie 19 Re´f´erences23

1

S. Dray, D. Chessel

1 Introduction Onconsid`ereuntableauY(nxs) avec l’abondance desnsseesdap`ecnsites. Undeuxie`metableauXcontient les mesures depseneivornnmeneatles`albairav nesnianylnadtudsiripleuxtetssites.Chaqateuaelbueputeˆttrret´aiarepeaun d’analyse simple (X,Q 1 ,D) et (Y,Q 2 ,D). Ilyatroisstrat´egiesprincipalesd’associationdedeuxtableaux.Ellesre- couvrent,a`causedesnombreuxjeuxdeparam`etres,unvasteensemblede pratiques. Il suffit de saisir ces trois principes pour faire un choix, voire pour construire des associations originales dont on peut avoir besoin. Lecouplagededeuxtableauxdedonne´esestuneop´erationfondamentaleen e´cologiestatistique.Ondisposed’une´enormelitt´tusurlesujet.Parmiles era re baseshistoriquesondoitrappelerquelquesope´rationsfondamentales. 1.1 Ordination directe et indirecte En face du tableauYqu,euipettˆsore,noitanidro’deodth´eemun`aisum onretrouvedel’informationme´sologiquecontenuedansletableauX. Deux strat´egiessontenvisageables[Jongmanetal.,1987]: 1.uneordinationdirectedesreleve´setdesesp`eceslelongdu(oudes)gra- dient(s) de variables environnementales. 2.uneordinationdesrelev´esselonleurcompositionsp´ecifique,suivied’une interpr´etationdur´esultatobtenua`lalumi`eredeconnaissancesexte´rieures surlesespe`cesoulessites. Whittaker[1967]qualifiecesdeuxstrat´egies,respectivement,direct gradient analysisetindirect gradient analysis.

1.2 Juxtaposition Deuxtableauxayantlesmˆemeslignessontsimplementaccol´espourformer un nouveau tableau qui appelle une analyse simple.

LogicielRversion2.10.0(2009-10-26)–ter3.rnw–Page2/24–Compile´le2009-11-18 Maintenance : S. Penel, URL :tth-vylu.inbpli:p///pdffr/Ron1./ter3.pdf