THESE DE DOCTORAT DE L'UNIVERSITE STRASBOURG I

Marie Umber

Description

Niveau: Supérieur, Doctorat, Bac+8
THESE DE DOCTORAT DE L'UNIVERSITE STRASBOURG I Discipline : Sciences du vivant Spécialité : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie présentée à la Faculté des Sciences de la Vie par Marie UMBER pour obtenir le titre de Docteur de l'Université Louis Pasteur ETUDE DE L'ONCOGENE ORF8 D'AGROBACTERIUM soutenue le 08 octobre 2004 devant le jury composé de : Prof. L. OTTEN Directeur de thèse Prof. F. BERNIER Rapporteur interne Dr.C. d'HULST Rapporteur externe Dr. X. NESME Rapporteur externe Institut de Biologie Moléculaire des Plantes UPR CNRS 2357

• département de biologie cellulaire


• bernier rapporteur interne


• merci


• institut de biologie moléculaire des plantes upr


• membre de jury


• ton sourire

Sujets

• Bernier
• Louis Pasteur University
• Wagner
• Erhardt
• Steinmetz
• Mot apparenté
• Hammann

Informations

• Publié par: profil-zyak-2012
• Publié le: 01 octobre 2004
• Nombre de lectures: 165
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 39 Mo

Extrait

THESE DE DOCTORAT DE L’UNIVERSITE STRASBOURG I
Discipline : Sciences du vivant
Spécialité : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
présentée à la Faculté des Sciences de la Vie
par
Marie UMBER
pour obtenir le titre de
Docteur de l’Université Louis Pasteur
ETUDE DE L’ONCOGENE ORF8 D’AGROBACTERIUM
soutenue le 08 octobre 2004 devant le jury composé de :
Prof. L. OTTEN Directeur de thèse
Prof. F. BERNIER Rapporteur interne
Dr.C. d’HULST Rapporteur externe
Dr. X. NESME R
Institut de Biologie Moléculaire des Plantes
UPR CNRS 2357A ma familleCe travail de thèse a été effectué au Département de Biologie Cellulaire de l’Institut de Biologie Moléculaire des
Plantes, sous la direction du Professeur Léon Otten.
Grand merci à Léon pour m’avoir accueillie dans son laboratoire et m’avoir encadrée durant cette thèse. Il m’a
témoigné une grande attention sur le déroulement de mon travail et a fait preuve de beaucoup de considération envers
moi. J’espère avoir acquis pendant ces quatre ans passés en sa compagnie toute la curiosité scientifique et l’ouverture
d’esprit qui le caractérise.
Je remercie vivement les membres du jury, François Bernier, Christophe d’Hulst et Xavier Nesme, d’avoir accepté de
juger ce travail.
Merci aux membres du labo 626, anciens ou nouveaux, qui m’ont aidée dans mon travail et m’ont supportée en tant
que voisine de paillasse. Merci à ma thésarde Anne, pour m’avoir initié aux joies du clonage avec tant de patience, merci à
Bernadette, pour sa constance, son calme et son efficacité, merci à P’tit Louis, pour m’avoir fait passer une année
merveilleuse, grâce à sa taquinerie et sa présence et enfin merci à mes stagiaires, Christel, Sylviane et Anne, pour m’avoir
épaulée avec tant de détermination et pour avoir apporté leur sourire à toutes ces journées de travail.
Je remercie très chaleureusement les jardiniers de l’IBMP, Sébastien Staerck, Richard Wagner, Aurélie Bailly et
Michel Kernéis, pour s’être occupés avec tant de patience de mes nombreuses plantes qui envahissaient leurs serres.
Le service de bioinformatique m’a été d’une grande aide quelques semaines avant de finir cette thèse, et je remercie
très sincèrement Valérie Cognat pour ses beaux alignements de séquences colorés qui illustrent cette thèse et surtout pour
sa patience. Merci également à Marc Bergdoll pour son étude sur la protéine A4-Orf8.
Merci au service séquençage, Philippe Hammann et Malek Alioua, pour leur efficacité et leur rapidité face à tous ces
clones que j’ai voulu séquencer, avec plus ou moins de succès.
Merci à Denise Meyer pour m’avoir guidée dans la préparation de coupes pour des immunolocalisations, même si ce
travail n’a pas encore porté ses fruits, pour ses discussions médicales et sa patience. Merci à Mathieu Erhardt pour avoir
tenté des localisations au microscope électronique avec mes plantes, mais aussi pour sa bonne humeur et sa gentillesse.
Merci à Jérôme Mutterer pour son initiation rapide, mais efficace, au microscope confocal, et encore félicitations.
Merci à André Steinmetz pour m’avoir si généreusement donné quelques µL de son plasmide pNTL2104.
Enfin, je tiens à exprimer ma reconnaissance au laboratoire d’Andréas Weber à Cologne, qui m’a accueillie avec
chaleur afin de m’initier à l’assimilation de CO radioactif par mes plantes, et plus particulièrement à Andréas qui a pris2
sur son temps pour m’encadrer et Lars pour son entière disponibilité et sa pédagogie.
Ensuite, je remercie les membres de la confrérie des grimpeurs, le mardi ou le jeudi entre midi et deux, Malek,
Herrade, Didier, Esther et Anne, pour m’avoir fait découvrir l’escalade et m’y avoir fait prendre goût. Je regretterai ces
moments à la fois de détente et d’efforts intenses.
Merci à Herrade, ma Maman d’adoption, pour son accueil si chaleureux dans le cercle fermé du quatrième étage,
pour son écoute, sa tendresse, son amitié et sa disponibilité.
Je remercie particulièrement toutes les personnes du café du quatrième, Yves, Marie-Claire, Pascal, Thomas et
Monika, pour toutes ces pauses en leur compagnie. Merci à Esther et Arnaud pour m’avoir soutenue pendant toutes ces
années, pour leur aide précieuse de tous les instants et pour leur sourire.
Merci à tous ceux qui m’ont aidée dans mon travail lorsque j’ai rencontré des problèmes techniques, Guillaume,
Laurent, Marina et j’en oublie beaucoup.
Merci aux amis de l’IBMP, ceux qui m’ont soutenue pendant ces quatre ans. Marina, ton amitié et ton écoute m’ont
permis de surmonter les moments difficiles, grâce à ton sourire et ton rire inoubliable. Merci à Alexis, pour toutes nos
chamailleries et nos rigolades. Merci aux ‘girls’ de la cantine, Rozenn, Thalia, Valérie, Céline et Didier, perdu au milieu de
toutes ces filles. Merci à Nanard, pour nos virées à la gravière ou à Caracalla. Merci à Guillaume, pour avoir partagé avec
moi ses goûts musicaux et littéraires.
Un grand merci à Antoine, qui a toujours été disponible pour moi lorsque j’avais des ennuis mécaniques, et mon vélo
lui en est reconnaissant.Merci à tous les autres membres de l’IBMP, ceux que j’ai oubliés et qui sont indispensables, Josette, Marie-Jeanne,
Martine et d’autres encore.
Un grand merci particulier à mes fistons messins, Philippe, Seb et Laurent, qui malgré la distance et le temps qui
passe ne m’ont jamais oubliée et ont toujours été contents de me revoir quand je passais à Metz. Je remercie spécialement
Philippe pour toute l’amitié qu’il me témoigne.
Merci à Stephele, ma petite belge d’adoption, qui m’a fait passer deux années de folie à la découverte de Strasbourg.
Merci à mon Seppele de m’avoir fait découvrir un monde que je ne connaissais pas.
Je remercie vivement tous mes amis de la ‘bande à Féfé’ d’avoir toujours été présents et de m’avoir acceptée dans
leur groupe. Merci particulier à Romain, Even, Did et Céline pour avoir bien voulu partager leurs soirées avec moi.
Je tiens à remercier mes parents, pour m’avoir guidée dans la vie et fait profiter de leur culture musicale et
scientifique, et merci particulier à mon père, qui m’a sans doute transmis ses gènes de la curiosité scientifique. Plein de
mercis à Jean, Anne, Jacques, Claire, Thérèse, Pierre, Odile et Emmanuelle, pour toute l’affection qu’ils me portent et que
seuls peuvent apporter des frères et sœurs. Leur présence me permet de me ressourcer et de ne pas oublier d’où je viens.
Merci enfin à Félix, pour tout ce qu’il m’a apporté et pour être simplement ce qu’il est.Sommaire

Sommaire


Introduction

I. Agrobacterium............................................................................................................... 1
1. Concepts généraux ................................................................................................................... 1
1.1. Le T-DNA ....................................................................................................................................... 1
1.2. La prolifération cellulaire................................................................................................................ 2
1.2.1. La galle du collet ........................................................................................................................ 2
1.2.2. Les chevelus racinaires............................................................................................................... 2
2. Processus d’infection................................................................................................................ 4
2.1. Reconnaissance bactérie/hôte.......................................................................................................... 4
2.2. Induction des gènes vir.................................................................................................................... 4
2.3. Transfert du T-DNA........... 5
2.3.1. Production du brin T................................................................................................................... 5
2.3.2. Le transporteur T.......... 6
2.3.3. Intégration dans le génome de l’hôte.......................................................................................... 6
II. Contenu du T-DNA et fonction des gènes .................................................................. 7
1. Synthèse des opines .................................................................................................................. 7
2. Synthèse d’hormones... 8
2.1. Agrobacterium tumefaciens et vitis .....................................