Bacterial community in the intertidal sediments populated by Arenicola marina, a terminal restriction fragment length polymorphisms study [Elektronische Ressource] / vorgelegt von Maya Shovitri
Bacterial community in the intertidal sediments populated by Arenicola marina,a terminal restriction fragment length polymorphism studyDISSERTATION ZurErlangung des Grades eines Doktors der Naturwissenschaften - Dr. rer. nat.- Dem Fachbereich Biologie/Chemie der Universität Bremen vorgelegt von Maya Shovitri ausIndonesien Bremen, 2008 Die Untersuchungen zur vorliegenden Doktorarbeit wurden am Max-Planck-Institut für Marine Mikrobiologie in Bremen durchgeführt 1. Gutachter : PD. Dr. Jens Harder, Universität Bremen 2. Gutachter : Prof. Dr. Rudolf Amann, Universität Bremen iContentsPage Summary iiiChapter 1: A general introduction, results and discussion 1.1. DNA finger printing 1 1.2. Terminal restriction fragment length polymorphisms (T-RFLP) 2 1.3. Non-metric multi dimensional scaling (NMDS) 6 1.4. Ecosystem, diversity and bioturbation 9 1.5. Arenicola marina 121.6. Marine intertidal sediments 14 1.7. Vertical zonation in marine sediments 15 1.8. Microbial community in the U-shaped burrow 17 1.9. Study aim 20 1.10. Overview on results and discussion 1.10.1. Method evaluation 22 1.10.2. Bacterial community in the intertidal sediments populated by Arenicola marina 27 1.11. Outlook 30 1.12.