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Publié par | Thesee |
Nombre de lectures | 26 |
Langue | English |
Poids de l'ouvrage | 5 Mo |
Extrait
UNIVERSITÉ DE LA MÉDITERRANÉE
AIX-MARSEILLE II
THÈSE
pour obtenir le grade de
DOCTEUR DE L’UNIVERSITÉ DE LA MÉDITERRANÉE
Discipline : Immunologie
École Doctorale des Sciences de la Vie et de la Santé
Caractérisation de BAD-LAMP dans les cellules dendritiques
plasmacyoïdes humaines
présentée et soutenue publiquement par
Axel DEFAYS
Le 6 décembre 2010
Directeur de thèse : Philippe PIERRE
Jury de thèse :
M. le Docteur Philippe Benaroch Rapporteur
M. le Docteur Vassili Soumélis Rapporteur
M. le Docteur Philippe Pierre Directeur de thèse
M. le Professeur Philippe Naquet Président du juryTable des Matières
Liste des abréviations................................................................................................... 3
La dynamique cellulaire............................................................................................... 7
I. Les voies de biosynthèse ...................................................................................... 7
1. La synthèse et l’export des protéines ............................................................ 7
2. La maturation des protéines ......................................................................... 9
3. La voie sécrétoire........................................................................................ 11
II. Le processus d’endocytose ............................................................................. 12
1. Les voies d’internalisation.......................................................................... 12
2. Les compartiments endocytiques ................................................................ 13
III. La famille des protéines membranaires associées aux lysosomes.................. 16
1. Caractéristiques générales ......................................................................... 16
2. Expression et fonction de LAMP1/2 ........................................................... 16
3. Les autres LAMPs ....................................................................................... 17
Les cellules dendritiques plasmacytoïdes ................................................................. 18
IV. Description générale des pDCs....................................................................... 19
1. Phénotype des pDCs humaines................................................................... 19
2. Origine développementale .......................................................................... 20
3. Localisation et migration des pDCs ........................................................... 21
4. Les pDCs murines ....................................................................................... 21
V. Les récepteurs de type Toll............................................................................. 22
11. Structure générale des TLR ........................................................................ 22
2. Spécificité de la reconnaissance ................................................................. 23
3. Signalisation ............................................................................................... 23
4. Régulation de l’adressage des TLRs........................................................... 25
VI. Fonction des pDCs humaines ......................................................................... 26
1. Des cellules productrices professionnelles d’interféron de type-1............. 26
2. La régulation de l’activation des pDCs ...................................................... 27
3. Les cellules dendritiques dérivées de pDCs................................................ 28
4. Autres fonctions des pDCs .......................................................................... 29
5. Importance clinique des pDCs in vivo ........................................................ 30
Objectifs....................................................................................................................... 33
VII. Contexte de l’étude ..................................................................................... 33
1. Etude de la forme murine de BAD-LAMP .................................................. 34
2. Fonction de l’homologue chez C. elegans 35
Résultats ...................................................................................................................... 36
VIII. Résumé de l’article 36
IX. Article ............................................................................................................. 38
Discussion .............................................................................. Erreur ! Signet non défini.
Références ............................................................................. Erreur ! Signet non défini.
Annexe 1 ................................................................................ Erreur ! Signet non défini.
Annexe 2 Erreur ! Signet non défini.
2Liste des abréviations
ACLL : motif d’adressage de type di-leucine DXXLL (pour Acidic cluster Leu-Leu)
AP : complexe adaptateur (pour Adaptor protein complex)
ARNm : acide ribonucléique messager
BAD-LAMP : Brain and dendritic cell lysosome-associated membrane protein
BDCA : Blood dendritic cells antigen
bHLH : domaine hélice-boucle-hélice (pour basic helix-loop-helix)
BiP : Binding protein
BST2 : Bone marrow stromal cell antigen 2
CCP : puits mantelés de clathrine (pour Clathrin-coated pits)
CCV : vésicules mantelées de clathrine (pour Clathrin-coated vesicles)
CD40L : ligand du CD40 (pour CD40 ligand)
cDC : cellule dendritique conventionnelle (pour Conventional Dendritic cell)
CLP : progéniteur commun lymphoïde (pour Common lymphoid progenitor)
CMH I : complexe majeur d’histocompatibilité de type I
CMH II : complexe majeur d’histocompatibilité de type II
CMKLR : récepteur de type chimiokine (pour Chemokine-like receptor)
CMP : progéniteur commun myéloïde (pour Common myeloid progenitor)
COPI et II : complexe des protéines manteau I et II (pour Coat protein complex)
CPA : cellules présentatrices de l’antigène
DC-LAMP : Dendritic-cell lysosome-associated membrane protein
DCIR : Dendritic cell immunoreceptor
[DE]XXXL[LI] : motif di-leucine Asp/Glu-X-X-X-Leu-Leu/Ile
ERES : sites de sortie du réticulum endoplasmique (pour Endoplasmic reticulum exit sites)
ESCRT : Endosomal complexes required for transport
3Fc!RII : récepteur de faible affinité pour les IgG
!"#$%& : chaîne !"#$"%écepteur aux immunoglobulines IgE à haute affinité
Fuc : fucose
GABA : &'(#)"!-aminobutyrique (pour !-aminobutyric acid)
Gal : galactose
GalNAc : N-acétylgalactosamine (pour Galactosamine N-acetyl)
GGA : Golgi-localizing, !-adaptin ear homology domain, ARF-binding protein
Glc : glucose
GlcNAc : N-acétylglucosamine (pour Glucosamine N-acetyl)
GM-CSF : facteur de croissance hématopoïétique granulocyte-macrophage (pour
Granulocyte-monocyte colony stimulating factor)
GPI : glycophosphatidylinositol
GTP : guanosine triphosphate
HEV : veinule à endothélium élevé (pour High endothelial venules)
ICOS-L : ligand de co-stimulation inductible des cellules T (pour Inducible T-cell co-
stimulator ligand)
IDO : Indoleamine 2,3-dioxygenase
IFN : interféron
IFNRA : récepteur à l’interféron-*"+,-$%"Interferon Receptor *)
IL : interleukine
ILT : Immunoglobulin-like transcript
IRF : facteur de régulation de l’interféron (pour Interferon regulatory factor)
JaK : Janus kinase
KDEL : séquence peptidique K (lysine)-D (acide aspartique)-E (acide glutamique)-L
(leucine)
KDELR : récepteur KDEL (pour KDEL receptor)
KIR : Killer cell Ig-like receptor
4LAMP : protéine membranaire associée aux lysosomes (pour Lysosome-associated
membrane protein)
LDL : lipoprotéine de basse densité (pour Low density lipoprotein)
LED : lupus érythémateux disséminé
Lin : marqueurs de restriction de lignée (pour Lineage markers)
LPS : lipopolysaccharide
LRR : domaines riches en leucine (pour Leucine-rich repeats)
Man : mannose
Man-6-P : mannose 6-phosphate
MoDC : cellule dendritique dérivée de monocyte (pour Monocyte-derived Dendritic cell)
MPR : récepteur mannose 6-phosphate (pour Mannose 6-phosphate receptor)
MVB : corps multi-vésiculaires (pour Multi vesicular bodies)
NCAM : Neural cell adhesion molecule
NF-'B : facteur de transcription nucléaire kappa B (pour Nuclear factor-kappa B)
NK : Natural killer
NPXY : motif tyrosine Asn-Pro-X-Tyr
ODN : oligodéoxynucléotide
OLS : organe lymphoïde secondaire
OST : complexe oligosaccharyltransférase
PACSIN : Protein kinase C and casein substrate in neurons
PAMP : motif moléculaires associés aux pathogènes (pour Pathogen-associ