Étude du contrôle de l’expression des systèmes de sécrétion de type III, généré par l’inactivation du gène yfgL codant une lipoprotéine de la membrane externe, chez Salmonella Enteritidis, Study of the control of Type III secretion system expression, resulting from the inactivation of the gene yfgL coding an outer membrane lipoprotein, in Salmonella Enteritidis

Yann Fardini

Description

Sous la direction de Philippe Velge
Thèse soutenue le 01 février 2008: Tours
Les salmonelles, responsables de fièvres typhoïdes et gastro-entérites, sont un problème majeur de santé publique. Les systèmes de sécrétion de type III (TTSS) sont des facteurs de virulence cruciaux de Salmonella. Nos travaux ont montré que délétion du cadre ouvert de lecture yfgL conduit à une faible transcription des gènes codant les 3 TTSS conduisant à une baisse importante de la virulence de Salmonella Enteritidis. Or, la délétion de ce gène, dont la protéine chez E.coli est en complexe avec les protéines YaeT, YfiO, NlpB et SmpA, conduit à une altération de la membrane externe. Chez S. Enteritidis, nous avons montré que le rôle du complexe « YaeT » dans l’assemblage des protéines de membrane externe est conservé. Or, seule l’inactivation d’yfiO, conduit une diminution de l’expression des TTSS. Nos travaux ont toutefois suggéré que le défaut d’assemblage des protéines de membrane externe n’est pas la cause de ce défaut d’expression des TTSS observés chez les mutants yfgL et yfiO.
-Salmonella Enteritidis
-Systèmes de sécrétion de type III
-YfgL
-Virulence
-Complexe YaeT
-Biogenèse de la membrane externe
-Contrôle
Salmonella, responsible for typhoid fever and gastroenteritis, is a worldwide health problem. Type three secretion system (TTSS) are crucial virulence factors in Salmonella. Our work showed that deletion of the open reading frame yfgL led to a transcriptional down-regulation of the genes encoding the proteins involved in the biosynthesis of the 3 TTSS in Salmonella Enteritidis. It was shown that inactivation of yfgL whose encoded protein is in complex with YaeT, YfiO, NlpB and SmpA in E. coli, causes an outer membrane alteration. In S. Enteritidis, we observed that the role of the “YaeT” complex in outer membrane protein assembly is conserved in S. Enteritidis. In addition, only yfiO inactivation resulted in a down-expression of the TTSS. However, we presented elements suggesting that the outer membrane protein targeting defect was not responsible for the TTSS down-expression observed in the yfgL and yfiO mutants.
Source: http://www.theses.fr/2008TOUR3301/document

Sujets

• Virulence
• Contrôle

Informations

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• Poids de l'ouvrage: 8 Mo

Extrait

UNIVERSITÉ FRANÇOIS - RABELAIS
DE TOURS


ÉCOLE DOCTORALE Santé, Sciences et Technologies
Unité INRA IASP 311 : « Signalisation, Portage et Virulence bactérienne »

THÈSE présentée par :
Yann FARDINI

soutenue le : 1 Février 2008


pour obtenir le grade de : Docteur de l’université François - Rabelais
Discipline/ Spécialité : Sciences de la Vie et de la Santé

Étude du contrôle de l’expression des
systèmes de sécrétion de type III, généré par
l’inactivation du gène yfgL codant une
lipoprotéine de la membrane externe, chez
Salmonella Enteritidis

THÈSE dirigée par :
M. VELGE Philippe Directeur de Recherches, INRA, Tours

Co-directeur :
Mme VIRLOGEUX-PAYANT Isabelle



JURY :
M. BOSSI Lionello Directeur de Recherches, CNRS, Gif-sur-Yvette
M. GUILLOT Jean-François Professeur, Université François Rabelais, Tours
Mme JACOB-DUBUISSON Françoise Directrice de Recherches, INSERM U629, Institut Pasteur,
Lille
Mme NOREL-BOZOUKLIAN FrançoiseChargée de Recherches, Institut Pasteur, Paris
M. PUGSLEY Anthony Professeur, Institut Pasteur, Paris
M. VELGE Philippe Directeur de Recherches, INRA, Tours 1REMERCIEMENTS
Les travaux de cette thèse ont été réalisés à l’INRA de Tours, dans l’Unité IASP 311
dirigée par M. Jean De Rycke. Ces travaux ont été co-financés par la Région Centre et
l’INRA.
Je tiens à remercier M. Philippe Velge de m’avoir permis de réaliser cette thèse au
sein de l’équipe « Signalisation, Portage et Virulence bactérienne » qu’il anime et surtout
d’avoir bien voulu revêtir la casquette officielle de Directeur de ma thèse. J’espère que tu ne
seras jamais amené à le regretter… Plus sérieusement, je tiens à te remercier d’avoir
toujours gardé un œil même lointain sur l’évolution du travail malgré tes très nombreuses
(qui a dit trop ?) occupations, ainsi que pour tes commentaires et suggestions pas toujours
réalisables mais souvent pertinents. Enfin, merci d’avoir contribué à l’amélioration de ce
manuscrit.
Naturellement, je tiens à exprimer toute ma gratitude envers ma vraie « patronne »,
Mme Isabelle Virlogeux-Payant. Merci, d’avoir encadré ma thèse dans une ambiance si
amicale. Merci, pour ta disponibilité sur le plan technique (je suis ravi de t’avoir donné des
prétextes pour mettre ta blouse) ainsi que sur le plan scientifique. Je ne peux que reconnaître
que tu y es pour beaucoup dans l’amélioration de ce manuscrit et de mes compétences en
rédaction, plus généralement. Bon, j’admets qu’au bout de quinze versions, il est temps de
dire « stop », mais le résultat est bien réel : ma rigueur et mon écriture ne sont plus les
mêmes. A la vue de ce manuscrit qui n’est pas parfait, je vous laisse donc imaginer ce que
c’était avant. Enfin, je dois également avouer que l’on a bien rigolé tout en sachant être
sérieux, tout au long de cette thèse et pour ça je t’en remercie.
Je ne pourrais partir le cœur léger sans remercier Jérôme Trotereau (avec un « t »,
oui je fais attention…). Au-delà d’un collègue de travail, c’est un vrai « pote » qui en est
ressorti. Merci pour la formation technique que tu m’as délivrée ainsi que pour ta rigueur (je
ne parlerai pas de « maniaquerie »). J’ai beaucoup appris. Encore une fois, si j’ai eu le
sourire aussi souvent au labo et pendant ces « petits moments de détente », c’est aussi par
« ta faute » !
Un petit coucou à un ancien membre de l’équipe qui s’en est allé dans d’autres
contrées, M. Sébastien Holbert. Merci, pour toutes nos franches rigolades, pour nos
discussions scientifiques, techniques et plus légères aussi. Je te suis reconnaissant de m’avoir
ôté quelques illusions sur le monde dans lequel on vit, ce qui me permettra de tomber de
moins haut ou encore de mieux esquiver. Tu m’as également montré que l’on pouvait faire
plein de choses, le tout étant de s’en donner les moyens. Pour ça, je t’exprime ma sincère
amitié et mon respect.
2D’une manière générale, je tiens à exprimer mes sincères remerciements à l’ensemble
de l’équipe, dans le désordre : Elisabeth, Agnès, Etienne, Sylvie, Olivier, Vincent, Pierrette.
Merci pour votre accueil ainsi que pour les bons moments passés. Je tiens à remercier tout
particulièrement Elisabeth, pour sa gentillesse sans limites et sa disponibilité pour réaliser
ces tests cellulaires, encore et encore, et…encore….
Une « spéciale cacedi » à tous les membres de l’équipe des « bras cassés » de l’unité
encore présents ou déjà partis : Stéphanie, Marianne, Galliano, Benoît, François, Julien, et
bien d’autres. Nous nous sommes bien amusés, ce qui m’a permis de m’oxygéner l’esprit
pour mieux replonger dans cet océan sans fond que l’on appelle le quotidien de la thèse.
Je remercie tout spécialement les « pauvres malheureux » qui ont dû me subir comme
encadrant : Audrey, Charlène et Emmanuelle. J’espère vous avoir apporté autant que vous
m’avez apporté. J’ai beaucoup appris en tant qu’encadrant.
Je tiens à remercier chaleureusement les rapporteurs, Mme Françoise Jacob-
Dubuisson et Mme Françoise Norel-Bozouklian et les examinateurs, M. Lionello Bossi, M.
Jean-François Guillot et M. Anthony Pugsley, constituant mon jury de thèse, pour avoir
accepter d’analyser mon travail et d’y avoir, pour cela, donné de leur temps. Je tiens à vous
faire part de ma fierté de vous compter parmi ce jury.
Je te remercie également, Toi qui se reconnaîtra à la lecture de ces quelques lignes
qui ne sauraient exprimer tout ce que je ressens. Merci d’avoir été là dans ces moments (que
j’espère pas trop nombreux) où j’accusais une baisse de régime et de moral. Ton sourire et
tes rires m’ont donné la force de m’accrocher. Cette stabilité dans ma vie, je te la dois et si
aujourd’hui j’en arrive là, c’est aussi grâce à toi.
Pour terminer, je remercie et dédicace, l’ensemble de cette thèse à mes parents et à
mes deux frères, sans qui je ne serais pas la personne que je suis aujourd’hui. Merci pour
votre amour et votre contribution à faire de moi une personne meilleure. Même si cela
s’avère enfantin, je tiens à faire un clin d’œil tout particulier à ma Maman : les hauts et les
bas que l’on a connus sont la source de ma force et à l’origine même de la réussite ce travail.
Tout cela je te le dois.
Enfin, je remercie toutes les personnes qui de près ou de loin, ont contribué à faire de
cette thèse ce qu’elle est : un moment de ma vie, gravé dans la roche.
3SOMMAIRE
REVUE BIBLIOGRAPHIQUE............................................................................................. 8
1. Salmonella............................................................................................................... 12
1.1. Classification................................................................................................... 12
1.2. Caractéristiques de Salmonella ....................................................................... 12
1.2.1. L’antigène O............................................................................................ 13
1.2.2. L’antigène H 13
1.2.3. L’antigène Vi........................................................................................... 14
2. Les salmonelloses.................................................................................................... 14
2.1. Les infections systémiques à Salmonella........................................................ 15
2.1.1. Pathologie................................................................................................ 15
2.1.2. Traitement et prévention ......................................................................... 16
2.2. Les gastro-entérites à Salmonella.................................................................... 16
2.2.1. Pathologie 17
2.2.2. Traitement et prévention 17
3. Pathogénie et facteurs de virulence de Salmonella ................................................ 18
3.1. Modèles animaux d’étude ............................................................................... 18
3.2. Pathogénie ....................................................................................................... 20
3.3. Facteurs de virulence impliqués dans les interactions bactéries-cellules........ 22
3.3.1. Les facteurs communs aux bactéries