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Publié par | Thesee |
Nombre de lectures | 60 |
Langue | Français |
Poids de l'ouvrage | 13 Mo |
Extrait
AVERTISSEMENT
Ce document est le fruit d'un long travail approuvé par le
jury de soutenance et mis à disposition de l'ensemble de la
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http://www.culture.gouv.fr/culture/infos-pratiques/droits/protection.htm Nancy-Université
'\ .Université
Henri Poincaré
Faculté des Sciences & Techniques
U.F.R. Sciences et Techniques Biologiques
Ecole Doctorale Biologie, Santé, Environnement
Thèse
présentée pour l’obtention du titre de
Docteur de l’Université Henri Poincaré, Nancy-I
en Biologie Moléculaire
par Jean-Michel SALIOU
Etude sur le complexe TAR/Tat/cycline T1
Et
Etude des régulations de l’épissage de l’ARN pré-messager du virus
HIV-1 : effet global des protéines virales et analyse fine du rôle des
protéines SR ASF/SF2 et 9G8 au site accepteur A3
Soutenance publique le 05 Septembre 2008
Membres du Jury :
Rapporteurs : Mme Joëlle MARIE Directeur de Recherche INSERM, Gif-sur-Yvette
Mme AC. DOCK-BREGEON Directeur de Recherche CNRS, Illkirch
Examinateurs : Mr James STEVENIN Directeur de Recherche INSERM, Illkirch
Mr Alain KROL Directeur de Recherche CNRS, Strasbourg
Directeur de thèse : Mme Christiane BRANLANT Directeur de Recherche CNRS, Nancy
Laboratoire de Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, UMR 7567 CNRS-UHP Nancy I,
Faculté des Sciences et Techniques, BP 239, 54506 Vandœuvre lès Nancy Cedex, France. Nancy-Université
'\ .Université
Henri Poincaré
Faculté des Sciences & Techniques
U.F.R. Sciences et Techniques Biologiques
Ecole Doctorale Biologie, Santé, Environnement
Thèse
présentée pour l’obtention du titre de
Docteur de l’Université Henri Poincaré, Nancy-I
en Biologie Moléculaire
par Jean-Michel SALIOU
Etude sur le complexe TAR/Tat/cycline T1
Et
Etude des régulations de l’épissage de l’ARN pré-messager du virus
HIV-1 : effet global des protéines virales et analyse fine du rôle des
protéines SR ASF/SF2 et 9G8 au site accepteur A3
Soutenance publique le 05 Septembre 2008
Membres du Jury :
Rapporteurs : Mme Joëlle MARIE Directeur de Recherche INSERM, Gif-sur-Yvette
Mme AC. DOCK-BREGEON Directeur de Recherche CNRS, Illkirch
Examinateurs : Mr James STEVENIN Directeur de Recherche INSERM, Illkirch
Mr Alain KROL Directeur de Recherche CNRS, Strasbourg
Directeur de thèse : Mme Christiane BRANLANT Directeur de Recherche CNRS, Nancy
Laboratoire de Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, UMR 7567 CNRS-UHP Nancy I,
Faculté des Sciences et Techniques, BP 239, 54506 Vandœuvre lès Nancy Cedex, France.
REMERCIEMENTS
En premier lieu, je tiens à remercier Mme Christiane Branlant, pour m’avoir accueilli dans
son laboratoire, m’avoir permis de réaliser mon travail dans de bonnes conditions matérielles
et pour la formation scientifique qu’elle m’a donnée. Ses conseils, sa rigueur, son soutien et sa
recherche constante de nouvelles pistes lorsque nous étions face à des difficultés ont été
essentiels tout au long du travail expérimental. Je la remercie aussi très fortement pour son
effort considérable pour me guider lors de la rédaction de ce manuscrit.
J’adresse aussi tous mes remerciements à Joëlle Marie et Anne-Catherine Dock-Bregeon pour
avoir accepté d’être les rapporteurs de ce travail de thèse et de l’avoir lue pendant leurs
vacances. Je remercie aussi James Stévenin et Alain Krol pour leur participation au jury de
thèse.
J’adresse des remerciements tout particulier à James Stévenin qui a suivi une partie de mes
travaux dans le cadre de la collaboration avec notre équipe, qui m’a accueilli en stage dans
son équipe, qui nous a fourni les protéines SR qui ont été essentielles à l’étude des
régulations de l’épissage. Je le remercie vivement ainsi que Cyril Bourgeois pour leur aide
lors de la rédaction de l’article, ainsi que pour toutes les discussions que nous avons eues sur
les régulations de l’épissage alternatif. Je ne voudrais pas non plus oublier Renata Gattoni,
avec qui j’ai réalisé les premières analyses d’épissage in cellulo.
Je voudrais aussi remercier vivement Alain Van Dorsselaer et Sarah Sanglier avec qui nous
avons réalisé les analyses protéomiques et chez qui je travaille actuellement. Leur soutien et
leur compréhension m’ont permis d’envisager la fin de thèse et la phase de rédaction au plus
sereinement.
J’adresse également un large merci à tous les membres du laboratoire, à la fois pour leur
contribution de près ou de loin à ce travail, mais aussi pour la bonne ambiance générale à
laquelle chacun a contribué. Parmi eux, je remercie spécialement Athanase Visvikis qui m’a
formé dans le domaine des cultures cellulaires et transfections, Xavier Manival et Christophe
Charron qui m’ont apporté tous leurs conseils pour la partie structurale, Lilia Ayadi pour la
partie épissage in vitro. Un merci tout particulier aussi à Florence Oillo avec qui j’ai pu
travailler étroitement en fin de thèse. Le travail fourni était efficace, motivant et toujours
plaisant. Je n’oublie pas non plus les aides des débuts, Delphine et Benoit, avec qui il était bon
de discuter et partager scientifiquement ou amicalement.
Ces années de vie au labo 3 auront été aussi l’occasion de construire beaucoup plus qu’une
amitié avec mes compagnons de paillasse, Alan et Xavier, alors un grand merci à vous deux,
très sincèrement!
Et puis toute ma gratitude et mes sentiments vont vers mes amis et ma famille. Merci pour
votre soutien et pour tout ce que vous m’avez apporté depuis déjà longtemps. Cela représente
beaucoup pour moi.
Sommaire
SOMMAIRE
ABREVIATIONS ................................................................................................................. 5
PARTIE BIBLIOGRAPHIQUE ............................................................................................. 7
CHAPITRE 1 : Le rétrovirus HIV-1.................................................................................. 9
1. Généralités.................................................................................................................. 9
1.1. La pandémie ....................................................................................................... 9
1.2. Evolution phylogénétique................................................................................. 10
2. Le virion : génome et structure 12
2.1. L’ARN génomique ........................................................................................... 12
2.2. La structure du virion ....................................................................................... 14
3. Cycle réplicatif du virus HIV-1................................................................................ 16
3.1. La phase pré-intégrative ................................................................................... 16
3.1.1. Entrée du virion dans la cellule infectée .................................................. 16
3.1.2. Transcription inverse 18
3.1.3. Transport et intégration de l’ADN proviral dans le génome.................... 19
3.2. La phase post-intégrative.................................................................................. 21
3.2.1. Expression des gènes viraux..................................................................... 21
3.2.2. Assemblage, bourgeonnement et maturation des nouveaux virions ........ 27
3.2.3. Inhibition de la réponse immunitaire et apoptose .................................... 30
CHAPITRE 2 : Description générale de la transcription par l’ARN Pol II : cas
particulier de l’ADN proviral de HIV-1........................................................................... 33