Expression Libraries as Tools for the Development of Subunit Vaccines and Novel Detection Molecules for Orthopoxviruses [Elektronische Ressource] / Lilija Miller. Betreuer: Andreas Nitsche

Lilija Miller

Sujets

• Naturwissenschaften

Informations

• Publié par: technische_universitat_berlin
• Publié le: 01 janvier 2011
• Nombre de lectures: 25
• Langue: English
• Poids de l'ouvrage: 8 Mo

Extrait

 
Expression Libraries as Tools for the 
Development of Subunit Vaccines and Novel 
Detection Molecules for Orthopoxviruses 
 
vorgelegt von  
Diplom‐Ingenieurin  
Lilija Miller 
aus Berlin 
 

Von der Fakultät III – Prozesswissenschaften 
der Technischen Universität Berlin 
zur Erlangung des akademischen Grades 
Doktorin der Ingenieurwissenschaften 
‐Dr.‐Ing.‐ 

genehmigte Dissertation 



Promotionsausschuss: 
 
Vorsitzender:  Prof. Dr. L.‐A. Garbe 
Berichter:    Prof. Dr. R. Lauster    PD Dr. A. Nitsche 
Berichter:    Prof. Dr. J. Kurreck 
 
Tag der wissenschaftlichen Aussprache: 02. Dezember 2011 
 
Berlin 2011 
D83 

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
“You  can  accurately  judge  the  research  of  others  only  after 
you’ve done your own and can understand the messy reality 
behind what is so smoothly and confidently presented in your 
textbooks or by experts on TV.” [1] 
 
  ‐ I ‐  
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
To my parents, my sister and my other half 
  ‐ II ‐  
Acknowledgments 
As with all projects in life, this one wouldn’t have been possible to complete without 
the help of many persons, including my dear colleagues but also friends and family. It 
is thus highly likely that I won’t be able to acknowledge every single contribution by 
name. Therefore, in order to do justice, I would first like to thank everyone who helped 
me through this demanding but interesting time, independent of the kind of support!  
I am grateful to Andreas Nitsche for giving me the opportunity to do my PhD project 
and  for  continuously  providing  motivation  and  support.  Sincere  thanks  to  my 
colleague, my best friend, and my fellow in misery Daniel Stern!  Thank  you  for  the 
innumerable,  valuable  scientific  discussions,  for  frequent  encouragement  and  for 
always having a sympathetic ear. Without you the time would have been much harder! 
Further, I’d like to thank all members of the ZBS1 group for the friendly atmosphere, 
company during lunch, and the badminton tournaments.  
A great contribution to this thesis was done by the students I supervised during my 
PhD project. Lisa Schlicher, Isabel Choschzick, and Christoph Hapke contributed to the 
“Expression  library  project”  during  their  internships.  Marco  Richter  and  Christoph 
Hapke  further  contributed  to  this  project  by  completing  their  master’s  thesis  or 
bachelor’s thesis, respectively. Johannes von Recum contributed to the “Phage Display 
project”  within  the  scope  of  his  master’s  thesis.  I  am  thankful  to  Janine  Michel,  who 
helped  me  with  phage  display  selections  and  subsequent  peptide  characterization. 
Wojtek  P.  Dabrowski  contributed  to  the  same  project  by  programming  the  “Library 
Insert  Finder”  software  and  thus  considerably  simplified  the  search for the random 
peptide sequences.  
I am also grateful to the staff of the photo laboratory for taking  great  pictures  of 
various agar plates and nitrocellulose filters and for printing my posters.  
Jung‐Won Sim‐Brandenburg and Delia Barz gave me excellent technical assistance, 
whereas  the  staff  of  the  sequencing  lab,  namely  Julia  Tesch,  Silvia Muschter, Julia 
Hinzmann,  and  Marlies  Panzer  provided  me  with  numerous  DNA  sequences.  I  am 
grateful to all of you for becoming more than colleagues but also valuable friends.  
Sincere  thanks  to  Ursula  Erikli  for  copy‐editing  and  continuous suggestions for 
improving my English language skills.  
This  work  was  funded  within  the  BMBF/VDI‐financed  BiGRUDI  network  of  the 
Robert Koch Institute (RKI; Berlin). In this context I am also thankful to the members 
of the “Aptamer work group” for the valuable scientific discussions. 
Most grateful I am to my parents who shaped me to be the person I am today. They 
always give me the feeling of being the best person in the entire world and thus help 
me  to  overcome  moments  of  uncertainty.  Last  but  not  least,  I  am  grateful  to  my 
partner for sharing the cheery moments with me as well as for supporting me in times 
of despair. Thank you so much for always having the right word at the right moment 
and for all the cooking.  
  ‐ III ‐  
Declaration of Authorship 
I  certify  that  the  work  presented  here  is,  to  the  best  of  my  knowledge  and  belief, 
original and the result of my own investigations, except as acknowledged. The present 
work has not been submitted, either in part or whole, for a degree at this or any other 
University. Parts of this work have been published under the following title:  
Miller, L., Richter, M., Hapke, C., Stern, D., & Nitsche, A. (2011) Genomic Expression 
Libraries  for  the  Identification  of  Cross‐Reactive  Orthopoxvirus  Antigens.  PLoS  ONE 
6(7): e21950. Epub 2011 Jul 14.  
 
Berlin,  
 
 
Lilija Miller 
 
  ‐ IV ‐  
Abstract 
The global eradication of smallpox led to the cessation of routine  smallpox 
vaccination due to rare but severe adverse reactions. Today, more than 30