Modeling of flexible side chains for protein-ligand docking [Elektronische Ressource] / von Christoph Hartmann
166 pages
English

Modeling of flexible side chains for protein-ligand docking [Elektronische Ressource] / von Christoph Hartmann

Le téléchargement nécessite un accès à la bibliothèque YouScribe
Tout savoir sur nos offres
166 pages
English
Le téléchargement nécessite un accès à la bibliothèque YouScribe
Tout savoir sur nos offres

Sujets

Informations

Publié par
Publié le 01 janvier 2008
Nombre de lectures 8
Langue English
Poids de l'ouvrage 5 Mo

Extrait

Saarbrüc
c
Chains
ec
des
Side
Christoph
of
ebruar
for
hen
Univ
Do
v
aus
deling
Flexible
Protein-Ligand
akultäten
king
en
Dissertation
h-T
zur
hnisc
Erlangung
F
des
der
Grades
ersität
des
Saarlandes
Doktors
on
der
Hartmann
Naturwissensc
Bonn
haften
k
der
F
Naturwissensc
2008
haftlic
MoMax-Planc
un
V
Dr.
2005
008
Th
ag
k
Thorsten
An
v
Thomas
is
ert
v
h
u
him
ti
Prof.
her
K
ri
1.
Die
eit
Prof.
Jan
Juli
Lengauer,
2
ebruar
Joac
der
Prüfungsaussc
Prof.
T
mas
uss:
Ph.D.
Prof.
für
orsitzender:
in
des
angefertigt.
Dr.
Beirat:
W
I
Herfet
s
ollo
tes
Beric
v
Arb
terstatter:
wurde
9.
on
Dr.
uar
k
b
F
an:
Dr.
eic
quiums:
h
orliegende
Ph.
2008
D.
ter
2.
Leitung
Beric
on
h
Dr.
terstatter:
o
Prof.
Lenga
Dr.
er,
Hans-P
am
eter
k-Institut
Lenhof
Informa
Wissensc
k
h
Saarbrüc
a
en
f
ii
tlic
Dekzuv
durc
a
zur
mit
exibilit
w
or
e
FlexE.
etten
und
can
n.
estimate
hnik
able
zu
function
F
elin
etten
is
on
where
etten
das
c
Screening-Daten
OT
OT
ultiple
o
deli
durc
ectiv
t
complex,
m
hain
in
e-c
enn
A
en
errors.
bles
OT
IRECS
v
und
40
den
dels
der
of
als
zu
erimen
wurden
is
auf
w
onn
or
die
sin-
Screening-Exp
able
Fällen
that
denen
in
Seitenk
space
erw
y
sic
hains.
önnen.
A
A
wledge
Rotamere
the
OT
homologous
Bindungsanität
elop
estimmen,
its
der
partners
Das
do
elt
is
erzeugen,
that
für
predic-
l
do
et
uncertain,
v
eline
erlässig
for
die
screenin
der
successfully
ist
wn
Informationen
ensem
das
and
te,
i
erformance
R
hains.
programm
in
delli
ligand
eline

ro
R
mo
A
erden,
drug
mo
ccurately
dung
is
die
and
h
devised
solc
hain
terstützen
reliabl
l,
t
ettenk
are
Flexibilität
and
o
binding
die
the
Mo
pro
h
side
b
a
erden
is
B
where
R
include
abgeleitet
en
h
f
Ligandplazieru
wledge-based
ennen.
from
ist
of
Lage
used
Protein-Ligand-K
new
zu
directly
h
oth
K
pro-
indungspartner
OT
aufw
deling
IRECS
tain
wic
king
Proteinmo
conformations
le
is
En
side-c
on
IRECS,
Seiten
e
th
and
n
algorithm
erw
king
OT
to
ertun
p
Proteink
elop
ann
tested
bles
that
b
of
Flexibilität
protein
onformellen
database
eiligen
e
tieren.
is
h
con
zusätzlic
the
er
tify
homologen
OT
Mo
of
orlage
can
ä
Opti
the
ru
side
utzen.
screening
A
near-nativ
c
in
ex
R
einer
h
ru
it
c
a
ereinigt
b
40
le
nen
ts.
DUD
OT
Es
R
gezeigt
and
in
that
o
a
Seitenk
A
w
predict
on
the
und
gle
v
also
ten
m
k
design
in
side-c
hen
to
un
conformations
s
mo
l
represen
in
y
Seitenk
the
onformationen
comprises
h
y
der
the
etten
conformational
der
ng
h
of
v
anit
endete
resp
dellierungstec
cases
nic
e
t
of
her
c
estimm
cedure.
w
IRECS
k
protein-ligand
Die
also
e
dev
ertungsfunktion
to
OT
ev
wurde
kno
u
kno
ric
o
tige
if
und
side-c
ngen
sid
erk
conformations
R
conformations
A
a
auÿerdem
scoring
der
protein
die
one
eines
as
omplexes
w
erlässig
template
b
b
auc
in
w
R
die
optimization
onformationen
binding
B
cedure.
geringe
hain
ehler
mo
eisen.
con
Programm
and
wurde
A
t
c
k
small
um
pip
d
ed
l
e
zu
The
die
constructed
sem
d
v
comprises
Rotameren
hain
exible
R
k
are
en
A
a
tion
te
the
.
ri
v
c
end
IRECS
R
program
A
approac
Bew
This
g
dev
on
ip
onformationen
ed
k
is
zuv
ed
Ensem
on
v
b
Rotameren
targets
estimmen,
generating
die
the
und
can
k
g
Raum
mo
jew
DUD,
Seitenk
supp
repräsen
it
IRECS
that
auc
sho
in
iden
Lage
that
he
tain
üb
application
Seitenk
it
eines
R
Proteins,
bles
der
A
dellierung
correct
V
IRECS
dien
rotamers
w
signican
h
seiner
increase
m
exible
e
p
ngsprozedur
and
n
of
IRECS,
c
OT
exp
und
exibil
Do
ts
king-
I
Fl
cases
E
e
zu
whic
Mo
ECS
e
side
ngs-
structure-based
Do
hains
kingpip
guided
v
re
und
placemen
den
exib
P
y
tei
or
der
y
bank
ere
getestet.
k
This
ork
hes
ort
through
rotamers
for
tly
rend
deled.
te
Zusammenfassung
w
Diese
dass
Arb
Fällen
eit
exiblen
stellt
der
n
dellierten
e
etten
u
An
e
en
Metho
v
den
R
v
A
or,
IRECS
die
Leistung
die
on
strukturbasierte
erimen
Suc
deutlic
he
steigern
nac
an
h
iii
Wirkstoen
Abstracth
y
nd
Auc
Rat
egleitet
Caren
egutac
on
h
und
heitere
tes
erfahrene
Professor
te
e
Diese
mic
ic
e
ei
en
Kämp
der
.
immer

te.
Gleic
Arb
w
orsc
Mein
n
Andreas
seiner
dank
und
Nac
h
g
hen
Kritik
te.
te
erw
te
mic
e
André
en,
diese
nen
K
w
h
erster
hilfreic
Dominik
Promotion
für
ic
und
un
s
daÿ
e
h
w
wissensc
an
b
F
n
enso
für
Irv
Andreas
wie
Professor
die
sie
der
ei
ungsreise
her
gew
denen
Un
mit
Austausc
h
en
ommen
die
in
en-
h
him
Arb
h
Clauÿen
h
in
h
Firma
tes,
in
Sommer
en
orab
Applied
olle
gemac
k
und
c
der
c
b
für
rau,
onn
terstützt

e
W
ic
h
sc
etreut
ic
Iris
wiegereltern,
mic
zur
dank
i

i
mic
ür
hab
dsc
meiner
meines
ic
ungsaufen
h
Univ
Stelle
California,
b
d
eter
en.
Auc
c
gilt
h
un
n
Bereitsc
amilie
er
desto
der
amez
h,
he
diese
haft
mit
dank
Lengauer,
orsc
in
äre
zu
möglic
geholfen
sen
h
die
h
des
ten.
ademisc
onstruktiv
Dienstes,
Anfang
dafür
motivierenden
c
c
h
gespart
terstützung
Arb
Sc
.
in
Mitgliedern
und
c
h
Arb

Lemmen,
ic
e
her-
Marcus
edank
h

on
ic
r
Iris
eIT
Dietzen,
Biology
und
sie
en,
te
eit
h
hab
einen

  • Univers Univers
  • Ebooks Ebooks
  • Livres audio Livres audio
  • Presse Presse
  • Podcasts Podcasts
  • BD BD
  • Documents Documents