Thermodynamic concepts in adaptive resolution simulations [Elektronische Ressource] / Simón Poblete

Simon Poblete, 0.116, Tel. 165

Description

bvgebysikConceptsMainzintiagoA2010daptivJohanneseersitätResolutionPSiminulations.Mainz,DissertationbzurPhErlangungderdesGutenGradeserg-Univ"DoktorinderSimónobletehaften"orenamSanF(Chile)acNohemberThermohJanPrüfung:2011der20.muaründlicDatumhendeVgroÿkDieseklungArbgetestet.eitzubSimefasstInAhwird.mitKraft,denBereickderonzeptionelleneldesundunddellshenonEnharakterisieren,tESPResSoeineklungdesdResSAdiedaptiverteilungsfunktionen,ehResolutiondieSceitererhemehiedene(AendungdResS)in,einernisse,Methoeitungdeer-gebundenenderist,Molekular-derdynamik,eränderungwfürTheEnsemdiediebhzeitigegetestetSimEekteulationorrektureinesulationSystemunginhunScanalysiert.aushenguteAuösungen,Einussermöglicgesteigerthdert.derDieinSimsetztulationsdomäneonenteilttbinärenhergröbineieinenhenBereicennhmithlieÿlichöherermitunddieeinenolymer,BereicadaptivhdassmitdiegeringererdurcAuösung.hGekopponeltetsindZusammenfassungsiedurcAusserdemhheeinendynamiscÜbinergangsbannFlüssigkh,einfacindemestimmen.dieonMolekülederenfreiatomistiscdiundierenderkdurcönnen.

Sujets

• Physik

Informations

• Publié par: johannes_gutenberg-universitat_mainz
• Publié le: 01 janvier 2010
• Nombre de lectures: 27
• Langue: Deutsch
• Poids de l'ouvrage: 1 Mo

Extrait

erg-Univ
Thermo
em

oren
Concepts
der
in
Sim?n
A
(Chile)
daptiv
Ph
e
Guten
Resolution
in
Sim
oblete
ulations.
San
Dissertation
No
zur
er
Erlangung
ysik
des
Johannes
Grades
b
"Doktor
ersit?t
der
Mainz

P
haften"
geb
am
in
F
tiago
ac
Mainz,
h
v
b
b

2010
huar
Datum
20.
der
Pr?fung:
m
Jan
?ndlic
2011
hender
Zusammenfassung
erteilung
Diese
anon-
Arb
des
eit
Es
b
b
efasst
ulationen

dieser
h
dResS
mit
Die
den
die
k
h
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P
und
no

Materialkunde

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hen
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En
einem
t
in

Soft
klung
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des
hen
A
und
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Un
e
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Resolution
mit
Sc
un
heme
Sc
(A
An
dResS)
zu
,
h?herer
einer
h
Metho

de
b
der
Kr?ften
Molekular-
seine
dynamik,
F
w
der

die
he
eil
die
ble.

Thermo
hzeitige
ek
Sim
wird,
ulation
v
eines
im
System
wurden
in
der
un
windigk

h

Deren
hen
rein
Au?sungen,
?b
erm?glic
des
h
wird.
t.
En
Die
f?r
Sim
der
ulationsdom?ne
seine
teilt
tensystemen

wird
h
Misc
in
erte
einen
bringt
Bereic
Kraft
h
ihre
mit
h
h?herer
h
und
zw
einen
Sim
Bereic
dem
h
zu
mit
die
geringerer
P
Au?sung.
h
Gek
t
opp

elt
A
sind
bildet
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im
durc
hen
h
hilft
einen
Denition
?b
hes
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der

ten
h,
eit
indem
her
die
Die
Molek?le
A
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K
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he
k
Sim
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h
Der
h
erste
alen
T
Gesc
eil
Radialv
der
und
Dissertation
ankung
ist
elanzahl,
auf

die
Ergebnissen
thermo
hen
dynamisc
eine
he
ung,
K
dem
onsistenz
F
der
h
Metho
w
de
in
fokussiert,

die
dResS,
an
ersc
einem
endungen
?ssigen
ysik
Mo
ist,
dell
w
aus
omp

oraus.
hen
h
Molek?len
Darstellung
getestet
eines
und
ungsmo
v
v
eriziert
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wurde.
Dab
Die
Metho
Ergebnisse
dynamisc
erlaub
Ergeb-
en
w
die
t
Einf?hrung
no
des
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K
Sc
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das
der
Systemen
Thermo
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dynamischen
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Kr
v
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,
erlaubt
b
lung
ei
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dem
gezeigt,
ein
erteilung
externes
die
F

eld
Praxis
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V
ysik

alis-
eeinusst

der
he
Details

v
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im
teuktuationen
arepak
im
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Dissertation.
ergangsb
gro?k


h,
Ensem
die
Ausserdem
in
eine

he
hen
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A
dynamisc
dResS
Kraft,
Sim
in
ula-
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tionen
ann
auftreten,

k
Fl?ssigk
orrigiert.
getestet
A
einfac
dResS
zu
wird
estimmen.

Eekte
h
on
auf
dResS
ein
deren
System
orrektur
angew
atomistisc
andt,
Bereic
b
der
ei
ulation
dem
durc

die
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tersuc
zw
ung
ei
lok
un
V

der

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he
eiten,
Darstellungen
erteilungsfunktionen,
mit
k
iden
Sc
tisc
w
hem
der
Au?sungsniv
artik
eau
analysiert.
gegen
V
?b
h
erstehen.
analogen
Dieser
aus
einfac

he
Sim
T
zeigt
est
gute
erw
ereinstimm
eitert
die
die
ter
An
Einuss
w
externen
endbark
eldes
eit

der
gesteigert
Meth-
Ein
o
eiterer
de
hritt
v
der
on
t
einem
klung
Sc
A
hema
der
mit
v
adaptiv
hiedene
er
w
Au?sung
in
zu
Bioph
einem
und
Sc
n?tig
hema
setzt
mit
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adaptiv
endung
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Multik
Darstellung,
onen
in
v
dem
In
un
Hinsic

t

die
he
in
Kraftfelder,
Au?sung
die
bin?ren
auf
h
thermo
dells
dynamisc
seine
hen
ergr?b
K
(coarse-grained)
onsistenzargumen

ten
parametrisiert.
basieren,
ei
gek
die
opp
de
elt
Thermo
w
hen
erden
zufriedenstellende
k
nisse,
?nnen.
h
Die
enn
Metho
En
de

der
eine
Thermo

dynamischen
feinere
Kr
eitung
aft
en?tigt.
wurde
hlie?lic
in
wurde
dem
A
hier
in
dargestellten
mit
Beispiel
eik
erfolgreic
er-gebundenen
h
durc
angew
die
andt.
ulation
Ein
on
alternativ
Mo
er,
olymer,
auf
es
k
ist,
onstan
Darstel-
tem
adaptiv
Druc
v
k
getestet.
basierender
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Ansatz
dass
f?r
V
die
der
Deduk-
unktionen,
tion
die
der
olymerstruktur
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harakterisieren,
dynamisc
der
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Kraft,
eine
erm?glic
er?nderung
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Au?sung
t
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die
b
In
wird.
terpretation
Erl?uterung
des

A
hen
dResS
f?r
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Ausf?hrung
ersten
on
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dResS
hritt
ESPResSo
hin
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zu
et
einer
den

T
hen
dieser
Sim
ulationp
Summary
further
This
on
thesis
dev
w
a
ork
with
is
systems.
dev
the
oted

to
tested
the
v

t,
and
in


hnical
A
dev
hange
elopmen

t

of
y
the
The
A
insp
daptiv
particle
e
sim
Resolution
under
Sc
A
heme
its
(A
tation
dResS),

a
t,

w

olymer
metho
that
d
b
that
A
allo
ulation
ws
dditionally
the
a
sim
Thermo
ulation
ell
of
dResS
a
are
system
lo
with
distribution
dieren
er
t
ing
lev
go
els
greatly
of
the
resolution
dev
sim
sev
ultane-
material
ously
ulti-
.
aim,
The
del
sim

ulation

domain
a
is
satisfactory
divided
in
in
b
to
a
high
to
and
It
lo
that
w
in
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hange
zones
the
and
ESPResSo
a
ork.
transition
the
region
ble.
that

links
leads
them,
w
through
determining
whic
F
h
the

tetrahedral

of
freely
this
diuse.

The
b
rst
ing
issue
distribution
of

this
pressure
w
um
ork
Their
regards
results
the
purely
thermo
sho

d

h
of
v
the
eect
metho
eld.
d,
in
whic
t
h

is
appli-
tested
ysics
and

v
to
eried
onen
in
o
a
high-resolution
mo
a
del
mixture
liquid
with
of
tation
tetrahedral
The


The
t
results

allo
giv
w
Finally
the
is
in

tro
o

forces,
of
ulation
the
del

w
of
ely
the
represen
Thermo
sho

distribution
F



an
not
external
the
eld
resolution.
able
details
to
tation

in
spurious
k
densit
thesis
y
sim

in
presen
Grand
t
ensem-
in
A
the
,
transition
h
region
denition
in
to
usual

A
a
dResS
of
sim
the
ulations.

The

A
in
dResS
w
is
studied
also
liquid.
applied
eects