Annie Anzieu a étudié la philosophie et la psychologie (avec Daniel Lagache) à Paris après la fin de la Seconde Guerre mondiale. En 1947, elle a épousé son condisciple Didier Anzieu (1923-1999), leur fille Christine est née en 1950, leur fils Patrick, en 1953.Didier Anzieu était le fils de Marguerite Anzieu, née Pantaine, qui a été hospitalisé à Sainte-Anne en 1931 et est devenu connu sous le nom célèbre affaire de Jacques Lacan de «Aimée». Didier Anzieu, qui
n'avait aucune idée de ce lien, a commencé une analyse avec Lacan en 1949. Annie Anzieu a travaillé comme psychologue, et a enseigné la philosophie, avant qu'elle ne devienne un logopède et psychothérapeute à l'hôpital de la Salpêtrière à Paris en 1958. En collaboration avec Daniel Widlöcher, elle a fondé le département de la psychothérapie pour les enfants à la Salpêtrière, où elle a mené pendant de nombreuses années.