Staphylococcus aureus (collection Monographies de microbiologie)

Gautier Michel, Loir Yves Le

Description

Staphylococcus aureus est une bactérie pathogène majeure pour l'Homme et les animaux à sang chaud, tristement célèbre pour son exceptionnelle résistance aux traitements antibiotiques et son implication dans les infections nosocomiales.
S. aureus dispose d'un impressionnant arsenal de facteurs de virulence qui lui permet de coloniser la peau et les muqueuses de ces hôtes et d'y persister de façon asymptomatique. À la faveur d'une blessure ou d'une baisse de l'efficacité du système immunitaire de l'hôte, S. aureus peut déclencher un large panel d'infections opportunistes allant du simple furoncle à la septicémie mortelle.
Dans l'optique de répondre aux questions que cette bactérie suscite, cet ouvrage se présente comme une synthèse abordant tous ses aspects : taxonomie, écologie, physiologie, pouvoir pathogène, épidémiologie, contrôle et prévention.
Une place importante est donnée à l'antibiorésistance, aux facteurs de virulence, à leur régulation et aux infections à S. aureus chez l'homme. Les infections chez l'animal sont largement abordées de même que l'implication de S. aureus dans les toxi-infections alimentaires. Sont détaillés des approches très pragmatiques tels que les méthodes d'identification de l'espèce et de différenciation des souches de S. aureus ou les méthodes de détection dans les aliments (appliquées à la bactérie elle-même ou à ses toxines). Ses aspects sont complétés par les données les plus récentes concernant sa classification, son génome, ses besoins nutritionnels, ses stratégies de survie et de résistance aux stress et aux antibiotiques, son étiopathogénie, les sources de contamination, les éléments réglementaires.
Une trentaine de spécialistes d'horizons variés (bactériologie médicale et vétérinaire, sécurité alimentaire, recherche fondamentale) se sont associés pour rédiger cet ouvrage complet, didactique et riche d'une bibliographie de plus d'un millier de références.
Staphylococcus aureus s'adresse aux biologistes médicaux, aux techniciens d'analyses, aux enseignants de microbiologie et aux étudiants en BTS, IUT, Master ou préparant une formation supérieure en microbiologie.
Avant-propos.
Chapitre 1. Taxonomie et habitat. Identification de l'espèce au sein du genre. Critères et méthodes de différenciation des souches. Variabilité génomique des souches de S. aureus. Habitat.
Chapitre 2. Physiologie. Culture en laboratoire, méthodes d'isolement et de détection. Facteurs influençant la croissance de S. aureus. Sensibilité de la bactérie aux agents bactériostatiques ou bactéricides. Physiologie de la croissance en biofilm.
Chapitre 3. Problèmes sanitaires liés à la présence de S. aureus. Toxinogénèse de S. aureus dans les aliments : les toxi-infections alimentaires à staphylocoques. Les autres infections. Les infections nosocomiales à S. aureus. Infections à S. aureus chez l'animal (hors mammites). Les mammites dues à S. aureus.
Chapitre 4. Mécanismes moléculaires de pathogénicité. Les entérotoxines. Les facteurs de virulence autres que les entérotoxines. Index.

Informations

• Publié par: Tec & Doc - Editions Lavoisier
• Date de parution: 22 décembre 2009
• Nombre de lectures: 127
• EAN13: 9782743019099
• Licence : Tous droits réservés
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 3 Mo

Extrait

Monographies de microbiologie collection dirigée par JeanPaul Larpent

Staphylococcus aureus

Yves Le Loir Michel Gautier coordonnateurs

Collection « Monographies de microbiologie » dirigée par Jean-Paul Larpent

Staphylococcus aureus

Yves Le Loir Directeur de recherche INRA

Michel Gautier Professeur Agrocampus Ouest

Coordonnateurs

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Listeria e J.-P. Larpent, 3 édition, 2004

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Entérobactéries – Systématiques et méthodes de diagnostic B. Joly, A. Reynaud, 2002

© LAVOISIER, 2010 ISBN : 978-2-7430-1195-6 ISSN : 1625-9319

Toute reproduction ou représentation intégrale ou partielle, par quelque procédé que ce soit, des pages publiées dans le présent ouvrage, faite sans l’autorisation de l’éditeur ou du Centre français d’exploitation du droit de copie (20, rue des Grands-Augustins, 75006 Paris), est illicite et constitue une contrefaçon. Seules sont autorisées, d’une part, les reproductions réservées à l’usage privé du copiste et non destinées à une utilisation collective, d’autre part, les analyses et courtes citations justifiées dans le caractère scientifique ou d’information er de l’œuvre dans laquelle elles sont incorporées (loi du 1 juillet 1992 – art. L. 122-4 et L. 122-5 et Code pénal art. 425).

Table des matières

Les auteurs. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Liste des abréviations. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Avant-propos

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Chapitre 1 Taxonomie et habitat 1. Identification de l’espèce au sein du genre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.1. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.2. Identification de l’espèce au sein du genre . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.3. Comparaison des méthodes phénotypiques et moléculaires pour l’identification d’espèce . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2. Critères et méthodes de différenciation des souches . . . . . . . . . . . . . . 2.1. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.2. Choix d’une méthode de typage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.3. Les méthodes de typages . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.4. Pouvoir discriminant d’une méthode de typage et diversité d’une population . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.5. Variabilité des marqueurs et interprétation des résultats de typage 2.6. Micro-épidémiologie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.7. Macro-épidémiologie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.8. Génétique des populations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3. Variabilité génomique des souches deStaphylococcus aureus. . . . . . 3.1. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.2. La variabilité génomique chez. . . . . . . . . . . . . . . . . .S. aureus 3.3. Les mécanismes de la variabilité génétique chezS. aureus . . . . 3.4. L’auto-stop des autres éléments génétiques mobiles . . . . . . . . . 3.5. Variabilité génomique, phénotype et adaptation . . . . . . . . . . . . 3.6. Méthodes d’analyse de la variabilité génomique . . . . . . . . . . . . 3.7. Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4. Habitat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.1. Réservoirs deS. aureuschez les hôtes humains et animaux . . . 4.2. Dispersion et survie dans des environnements variés . . . . . . . . . 4.3. Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . © Lavoisier – La photocopie non autorisée est un délit

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Chapitre 2 Physiologie 1. Culture en laboratoire, méthodes d’isolement et de détection . . . . . . . 1.1. Caractères culturaux . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.2. Méthodes de détection deStaphylococcus aureus . . . . . . . . . . . 1.3. Méthodes de détection des entérotoxines . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2. Facteurs influençant la croissance deStaphylococcus aureus. . . . . . . 2.1. Facteurs nutritionnels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.2. Facteurs physico-chimiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.3. Conclusions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3. Sensibilité de la bactérie aux agents bactériostatiques ou bactéricides 3.1. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.2. Antibiotiques : mécanismes d’action . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.3. Mécanismes de résistance aux antibiotiques . . . . . . . . . . . . . . . . 4. Physiologie de la croissance en biofilm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.1. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.2. Méthodes d’obtention de biofilm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.3. Étapes de formation d’un biofilm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.4. Facteurs impliqués dans l’adhésion initiale . . . . . . . . . . . . . . . . 4.5. Facteurs impliqués dans l’agrégation intercellulaire . . . . . . . . . 4.6. Mécanismes de régulation impliqués dans la formation d’un biofilm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.7. Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Chapitre 3 Problèmes sanitaires liés à la présence deS. aureus 1. Toxinogénèse deS. aureusdans les aliments : les toxi-infections alimentaires à staphylocoques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.1. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.2. Clinique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.3. Incidence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.4. Croissance et toxinogénèse . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.5. Conditions nécessaires à l’apparition d’une TIAC à staphylocoques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.6. Un épisode d’intoxication alimentaire de grande ampleur . . . . . 1.7. Prévention . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2. Les autres infections. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.1. Importance du portage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.2. Les infections suppuratives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.3. Les pathologies toxiniques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.4. Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3. Les infections nosocomiales àStaphylococcus aureus. . . . . . . . . . . . 3.1. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.2. Définition de l’infection nosocomiale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.3. Les principales infections nosocomiales et leurs modes de transmission . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.4. Les bactéries en cause et les conséquences . . . . . . . . . . . . . . . . .

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Table des matières

3.5. Existe-t-il des caractéristiques spécifiques aux souches deStaphylococcus aureusisolées dans les infections nosocomiales ? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.6. Les traitements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4. Infections àStaphylococcus aureus.chez l’animal (hors mammites) 4.1. Types d’infections chez l’animal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.2. Maladies spécifiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.3. Diagnostic des staphylococcies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5. Les mammites dues à Staphylococcus aureus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5.1. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5.2. Données épidémiologiques, importance économique et sanitaire chez les ruminants laitiers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5.3. Caractéristiques cliniques, pathogénie et immunobiologie . . . . . 5.4. Caractéristiques liées à la virulence des souches responsables de mammites . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5.5. Prophylaxie, moyens de lutte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Chapitre 4 Mécanismes moléculaires de pathogénicité 1. Les entérotoxines . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.1. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.2. Principales caractéristiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.3. Les supports génétiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.4. Activités des SE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.5. Conclusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2. Les facteurs de virulence autres que les entérotoxines . . . . . . . . . . . . 2.1. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.2. Les protéines de surface et la capsule . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.3. Les toxines . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.4. Les exo-enzymes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.5. Les nouveaux facteurs de virulence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.6. Les systèmes de régulation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2.7. Impactin vivode la régulation de la virulence . . . . . . . . . . . . . Index. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

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Les auteurs

Nouri Ben Zakour Laboratory for Bacterial Evolution and Pathogenesis, université d’Édimbourg. Royaume-Uni

Éric Beuvier UR342 Technologie et analyses laitières, INRA Poligny

Dominique S. Blanc Faculté de biologie et de médecine, université de Lausanne, CHU Vaudois, Lau- sanne, Suisse

Sandrine Boisset Université Lyon 1, Centre national de référence des staphylocoques, INSERM U851, Lyon

Élise Borezée-Durant Unité bactéries lactiques et pathogènes opportunistes, INRA Jouy-en-Josas

Cathy Charlier UMR1253 science et technologie du lait et de l’œuf, INRA Agrocampus Ouest, Rennes

Olivier Dauwalder Université Lyon 1, Centre national de référence des staphylocoques, INSERM U851, Lyon

Marie-Laure De Buyser Laboratoire d'études et de recherches sur l'hygiène et la qualité des aliments, AFSSA Maisons-Alfort

Céline Delbès Laboratoire de recherches fromagères, INRA Aurillac Pierre-Yves Donnio Service de bactériologie-virologie et hygiène hospitalière, CHU, Rennes, France Sergine Even UMR1253 science et technologie du lait et de l’œuf, INRA Agrocampus Ouest, Rennes Tristan Ferry Université Lyon 1, Centre national de référence des staphylocoques, INSERM U851, Lyon © Lavoisier – La photocopie non autorisée est un délit

VIII

Staphylococcus aureus

Michel Gautier UMR1253 science et technologie du lait et de l’œuf, INRA Agrocampus Ouest, Rennes

Florence Gilbert UR1282 Infectiologie animale et santé publique, INRA Nouzilly

Jacques-Antoine Hennekinne Laboratoire d'études et de recherches sur l'hygiène et la qualité des aliments, AFSSA Maisons-Alfort

François Jehl UPRES EA-3432 Physiopathologie des interactions hôte-bactérie, Institut de bactériologie de la faculté de médecine, Strasbourg

Vincent Juillard Unité bactéries lactiques et pathogènes opportuniste INRA Jouy-en-Josas

Gerrit Kuhn Université de Lausanne, Médecine préventive hospitalière, CHU Vaudois, Lau- sanne, Suisse

Yves Le Loir UMR1253 science et technologie du lait et de l’œuf, INRA Agrocampus Ouest, Rennes

Sabine Leroy UR 454 Microbiologie, INRA Clermont-Ferrand

Gérard Lina Université Lyon 1, Centre national de référence des staphylocoques, INSERM U851, Lyon

Marie-Christine Montel Laboratoire de recherches fromagères, INRA Aurillac

Jean-Louis Pellerin Unité de microbiologie, département de pathologie générale, École nationale vétérinaire de Nantes

Marie-Agnès Petit Unité bactéries lactiques et pathogènes opportunistes, INRA Jouy-en-Josas

Stella Planchon UR 454 Microbiologie, INRA Clermont-Ferrand

Gilles Prévost UPRES EA-4438 Physiopathologie et médecine translationnelle, Institut de bac- tériologie de la faculté de médecine, Strasbourg

Pascal Rainard UR1282 Infectiologie animale et santé publique, INRA Nouzilly

Régine Talon UR 454 Microbiologie, INRA Clermont-Ferrand

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