Virus émergents

Hélène Coignard-Biehler, Véronique Avettand-Fènoël, Etienne Canouï

Description

« Les maladies infectieuses : il en naîtra de nouvelles, il en disparaîtra lentement quelques-unes ; celles qui subsisteront ne se montreront plus sous les formes que nous leur connaissons aujourd’hui », Charles Nicolle (1933).IntroductionLe concept de maladie virale émergente a été créé en 1989 par des épidémiologistes américains, ce terme de maladie virale émergente s’appliquant aux cas suivants :– un syndrome qui associe de façon originale une étiologie et des symptômes non observés jusque-là par la médecine (maladie nouvelle stricto sensu) : exemple du SIDA au début des années 1980 ;– une affection qui n’a encore jamais été identifiée dans une zone géographique ou un environnement humain donné : exemple du virus West Nile aux États-Unis ;– une affection qui réapparaît là où elle avait disparu, ou dans un environnement nouveau : exemple de la fièvre jaune ou de la dengue hémorragique en Amérique du Sud ;– une affection dont l’étiologie est nouvellement décrite (maladie connue, virus nouveau) : exemple de l’hépatite C ou des fièvres hémorragiques dues aux virus Ebola, Lassa, Marburg (Tableau S32-P02-C15-I).

Sujets

• Maladie infectieuse

Informations

• Publié par: Editions du Traité de Médecine
• Date de parution: 01 janvier 2020
• Nombre de lectures: 0
• Langue: Français
• Poids de l'ouvrage: 1 Mo

Extrait

1

Maladies infectieuses

Chapitre S32P02C15 Virus émergents

E TIENNE C ANOUÏ , V ÉRONIQUE A VETTAND -F ÉNOËL , H C -B ÉLÈNE OIGNARD IEHLER

0 7 01 0

5 1 -C 2 P0 2- S3

« Les maladies infectieuses : il en naîtra de nouvelles, il en disparaîtra lentement quelques-unes ; celles qui subsisteront ne se montreront plus sous les formes que nous leur connaissons aujourd’hui », Charles Nicolle (1933).

Introduction

Le concept de maladie virale émergente a été créé en 1989 par des épidémiologistes américains, ce terme de maladie virale émergente s’appliquant aux cas suivants : – un syndrome qui associe de façon originale une étiologie et des symptômes non observés jusque-là par la médecine (maladie nouvelle stricto sensu) : exemple du SIDA au début des années 1980 ; – une affection qui n’a encore jamais été identifiée dans une zone géographique ou un environnement humain donné : exemple du virus West Nileaux États-Unis ; – une affection qui réapparaît là où elle avait disparu, ou dans un environnement nouveau : exemple de la fièvre jaune ou de la dengue hémorragique en Amérique du Sud ; – une affection dont l’étiologie est nouvellement décrite (maladie connue, virus nouveau) : exemple de l’hépatite C ou des fièvres hémor- ragiques dues aux virus Ebola, Lassa, Marburg (Tableau S32-P02-C15-I). Les maladies infectieuses émergentes sont ainsi définies comme des infections nouvellement apparues au sein d’une population, issues le plus souvent d’un réservoir animal comme nous l’enseignent les grandes pandémies (variole, grippes, coronavirus 2019). Devant des infections dues à des virus préexistants qui augmentent rapidement leur incidence ou leur diffusion géographique, à la lumière de fac- teurs favorisant leur dissémination, nous parlerons alors de ré-émer- gence. Avec les progrès actuels de la virologie moderne grâce aux techniques nouvelles notamment de biologie moléculaire, il peut exister une confusion entre un virus réellement émergent ou un virus nouvellement identifié mais responsable d’une pathologie déjà connue sans étiologie identifiée. Ces maladies infectieuses du fait de leurs caractères nouveaux et par- fois soudains ont depuis toujours été un problème de santé publique tant sur le plan diagnostique et thérapeutique que sur le plan de la pré- vention et de la surveillance [1, 2]. Depuis les années 2000, les principales épidémies sont liées à des virus émergents et/ou ré-émergents. Les émergences virales notables des 100 dernières années sont listées dans le tableau suivant, non- exhaustif (voirTableau S32-P02-C15-I). Nous décrirons dans cet article : – les conditions d’émergence des nouveaux virus ; – les principaux virus émergents (éléments de virologie/ pathologie engendrée), présentés par mode de transmission préférentiel : respira- toire, vectorielle, contact, sexuelle ou « biologique » ;

S32P02C15

Tableau S32-P02-C15-I Historique des principaux virus émergents et ré-émergents depuis 1917.

Année

1917 1937 1957 1967 1968 1969 1976

1981 1986 1997

1998 1999 2002

2004 2009 2012

2013

2014 2019

Virus émergent

Grippe A H1N1 (grippe espagnole) West-Nile virus Grippe A H2N2 Marburg Grippe A H3N2 Lassa Ebola Hantaan Virus de l’immunodéficience humaine (VIH) Human Herpes Virus6 (HHV6) Grippe A H5N1 (grippe aviaire) Virus de l’hépatite E (VHE) Nipah virus

Severe Acute Respiratory Syndrom(SARS)- Coronavirus

Grippe A H1N1 (grippe porcine) Middle East respiratory Syndrome(MERS)- Coronavirus Zikavirus Grippe A H7N9

Severe Acute Respiratory Syndrom- Coronavirus 2(SARS-CoV 2) responsable du Covid-19 (Coronavirus disease 2019)*

Virus ré-émergent

West Nile virus

Chikungunya

Ebola

*(NDLR) Rédigé pendant le début de la pandémie de Covid-19, ce chapitre n'évoque pas ce virus.

– les conditions de prise en charge des pathologies virales émergentes dans notre système de santé.

Facteurs d’émergence et de ré-émergence virale

De manière générale, l’introduction d’un nouveau virus chez l’homme résulte de l’association de multiples facteurs liés à la fois aux virus et à l’homme : modifications climatiques, déplacements humains/transports aériens, conséquences écologiques des activités humaines, nouvelles tech- niques diagnostiques, relâchement de mesures sanitaires, alimentation, guerres, catastrophes naturelles induisant promiscuité, précarité. Le mode de transmission de l’animal à l’homme est également un facteur primor- dial dans l’émergence et la diffusion virale.

Facteur viral : évolution naturelle, mutation et réassortiment génétique

Les virus à ARN sont ceux qui présentent la plus grande capacité d’évolution. En effet, leur polymérase n’assure pas un recopiage fidèle des séquences d’origine, induisant en permanence la production de